Πληροφορίες

Αντοχή στα αντιβιοτικά

Αντοχή στα αντιβιοτικά


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Έχω ένα βιολογικό παζλ που με μπερδεύει εδώ και χρόνια. Μπορείτε να αναθεωρήσετε τη λογική μου και να μου πείτε πού κάνω λάθος ή αν ασχολούμαι με κάτι.

Όπως καταλαβαίνω, οι περισσότερες, αν όχι όλες οι γενετικές μηχανικές χρησιμοποιούν ένα γονίδιο δείκτη για να αναγνωρίσουν τα μετασχηματισμένα βακτήρια. Αυτό το γονίδιο δείκτη ήταν/είναι συνήθως ένα γονίδιο ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά, επομένως τα μετασχηματισμένα βακτήρια θα είναι τα μόνα που μπορούν να αναπτυχθούν σε ένα μέσο καλλιέργειας με δεμένα αντιβιοτικά.

Έτσι, κάθε (οι περισσότεροι) ΓΤΟ θα περιέχει ένα αντίγραφο ενός βακτηριακού γονιδίου ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά.

Επίσης, πιστεύω ότι τα βακτήρια μπορούν να αποκτήσουν αυθόρμητα DNA από το περιβάλλον τους ή/και άλλα βακτήρια.

Επομένως, είναι δίκαιο να αναρωτηθούμε εάν ο αφύσικος πολλαπλασιασμός των γονιδίων ανθεκτικών στα αντιβιοτικά στη φύση λόγω της εμπορικής διάδοσης των ΓΤΟ μπορεί να είναι τουλάχιστον εν μέρει υπεύθυνος για την αύξηση των πολυανθεκτικών οργανισμών που βλέπουμε;

Έχει κανείς, για παράδειγμα, πολτοποιήσει την ύλη ΓΤΟ, έχει προσθέσει βακτήρια που δεν είναι ανθεκτικά στα αντιβιοτικά, έχει αναπτύξει το μείγμα όλη τη νύχτα, έχει προσθέσει το αντιβιοτικό που χρησιμοποιείται ως δείκτης στον ΓΤΟ, έχει επωάσει για μερικές ημέρες και στη συνέχεια έχει δει εάν κάποιο βακτήριο επιβίωσε;


Όπως καταλαβαίνω, οι περισσότερες, αν όχι όλες οι γενετικές μηχανικές χρησιμοποιούν ένα γονίδιο δείκτη για να αναγνωρίσουν τα μετασχηματισμένα βακτήρια. Αυτό το γονίδιο δείκτη ήταν/είναι συνήθως ένα γονίδιο ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά, επομένως τα μετασχηματισμένα βακτήρια θα είναι τα μόνα που μπορούν να αναπτυχθούν σε ένα μέσο καλλιέργειας με κορδόνι με αντιβιοτικά

Οι περισσότεροι δείκτες εκτός από χρώμα (που δίνουν στο κύτταρο ξενιστή ένα χρώμα που μπορεί να χρησιμοποιηθεί για επιλογή) χρησιμοποιούνται επίσης. Χρησιμοποιούνται επίσης πιο περίπλοκοι επιλέξιμοι-μετρητές επιλέξιμοι δείκτες (δηλ. γονίδιο HyTK). Ένας δείκτης με δυνατότητα επιλογής μετρητή είναι ένας δείκτης που σκοτώνει ένα κελί όταν υπάρχει. Ένας επιλέξιμος δείκτης επιλογής μετρητή είναι ένας υβριδικός δείκτης που σας επιτρέπει να επιλέξετε κελιά με τον δείκτη χρησιμοποιώντας έναν παράγοντα επιλογής και να σκοτώσετε το ίδιο κελί με έναν δεύτερο παράγοντα επιλογής.

Έτσι, κάθε (οι περισσότεροι) ΓΤΟ θα περιέχει ένα αντίγραφο ενός βακτηριακού γονιδίου ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά.

Λοιπόν όχι ακριβώς. ΓΤΟ, δηλαδή γενετικά τροποποιημένος οργανισμός, περιλαμβάνει τόσο προκαρυώτες (βακτήρια) όσο και ευκαρυώτες (φυτά, ζώα και μαγιά). Οι προαγωγείς που καθοδηγούν τη γονιδιακή δραστηριότητα σε προκαρυώτες και ευκαρυώτες είναι διαφορετικοί. Οπότε οι ευκαρυωτικοί δείκτες δεν λειτουργούν στα προκαρυωτικά και το αντίστροφο.

Επιπλέον, η γενετική τροποποίηση των ευκαρυωτών είναι δύσκολη. Ως εκ τούτου, χρησιμοποιούνται συχνά τροποποιημένοι ιοί. Αυτοί οι ιοί είναι κατασκευασμένοι με τέτοιο τρόπο ώστε το γονιδίωμά τους να έχει αντικατασταθεί από το επιθυμητό φορτίο DNA. Και καθώς το μέγεθος του ωφέλιμου φορτίου είναι περιορισμένο, συχνά αφαιρείται και οποιοδήποτε περιττό DNA, όπως οι προκαρυωτικοί δείκτες που δεν έχουν καμία λειτουργία σε έναν ευκαρυωτικό ξενιστή.

Τέλος, λόγω της δημόσιας πίεσης, υπήρξε μια ώθηση προς τον καθαρισμό μετά από εργασίες γενετικής μηχανικής σε ΓΤΟ που πρόκειται να διατεθούν στο κοινό (καλλιέργειες ΓΤΟ). Έτσι, αφαιρούνται πράγματα όπως οι δείκτες επιλογής (είτε με τη χρήση μετρητών επιλέξιμων δεικτών ακολουθούμενη από ομόλογο ανασυνδυασμό είτε με ειδικές θέσεις ανασυνδυασμών).

Επομένως, είναι δίκαιο να αναρωτηθούμε εάν ο αφύσικος πολλαπλασιασμός των γονιδίων ανθεκτικών στα αντιβιοτικά στη φύση λόγω της εμπορικής διάδοσης των ΓΤΟ μπορεί να είναι τουλάχιστον εν μέρει υπεύθυνος για την αύξηση των πολυανθεκτικών οργανισμών που βλέπουμε;

Δεδομένης της ευρείας διαδεδομένης χρήσης αντιβιοτικών στην κτηνοτροφία και από το ευρύ κοινό, και την κατεύθυνση της αφαίρεσης των δεικτών επιλογής στους εμπορικούς ΓΤΟ, δεν νομίζω ότι οι ΓΤΟ είναι η αιτία της αύξησης των βακτηρίων MR.

Μια πιο πιθανή αιτία θα ήταν απλώς επειδή χρησιμοποιούμε τόσα αντιβιοτικά και επομένως υπάρχει μια πίεση επιλογής για να αποκτήσουμε πολλαπλή αντίσταση. Θυμηθείτε ότι όλα τα γονίδια ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά και τα περισσότερα από τα αντιβιοτικά μας αποκτήθηκαν από τη φύση.

Έχει κανείς, για παράδειγμα, πολτοποιήσει την ύλη ΓΤΟ, έχει προσθέσει βακτήρια που δεν είναι ανθεκτικά στα αντιβιοτικά, έχει αναπτύξει το μείγμα όλη τη νύχτα, έχει προσθέσει το αντιβιοτικό που χρησιμοποιείται ως δείκτης στον ΓΤΟ, έχει επωάσει για μερικές ημέρες και στη συνέχεια έχει δει εάν κάποιο βακτήριο επιβίωσε;

Ναι, πολλές φορές σε όλο τον κόσμο με διάφορους βαθμούς επιτυχίας. Προσωπικά έχω αφιερώσει χρόνο για να το κάνω αυτό, όπως και οι συνεργάτες μου. Θα λειτουργήσει εάν παρασκευάσετε DNA καλής ποιότητας που δεν έχει αποικοδομηθεί από τις ενδονουκλεάσες, τα βακτήρια είναι πολύ μετασχηματίσιμα (δηλ. τα βακτήρια έχουν υποστεί επεξεργασία για να προσλάβουν εύκολα DNA), η ηλεκτροδιάτρηση χρησιμοποιείται (για να εξαναγκάσει το DNA στο κύτταρο) και εσείς έχουν προκαρυωτικό δείκτη. Ένας ευκαρυωτικός δείκτης, είναι ένας δείκτης που λειτουργεί σε ζωικά κύτταρα δεν θα λειτουργήσει στα βακτήρια. Πρέπει λοιπόν να κατασκευάσετε το ζώο ΓΤΟ ώστε να φέρει τόσο ευκαρυωτικό όσο και προκαρυωτικό δείκτη.


Αντοχή στα αντιβιοτικά - Βιολογία

Αντοχή στα αντιβιοτικά είναι η ικανότητα ενός μικροοργανισμού να αντέχει τις επιδράσεις των αντιβιοτικών. Είναι ένα συγκεκριμένο είδος φαρμάκου αντίσταση. Αντοχή στα αντιβιοτικά εξελίσσεται μέσω της φυσικής επιλογής που ενεργεί με τυχαία μετάλλαξη, αλλά.
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Πληροφορίες για αντιβιοτικό/αντιμικροβιακό αντίσταση. Παρέχεται από τα Κέντρα Ελέγχου και Πρόληψης Νοσημάτων των ΗΠΑ. . και Απαντήσεις για Αντιβιοτικό Αντίσταση .
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Αντιβιοτικό Αντίσταση Αντιβιοτικό αντίσταση είναι η ικανότητα ενός βακτηρίου ή άλλου μικροοργανισμού να επιβιώνει και να αναπαράγεται παρουσία του
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Η FDA των ΗΠΑ παρέχει πληροφορίες σχετικά με τους οργανισμούς που προκαλούν ασθένειες που έχουν γίνει ανθεκτικοί στη φαρμακευτική θεραπεία είναι ένα αυξανόμενο πρόβλημα δημόσιας υγείας.
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Μάθετε περισσότερα για το αυξανόμενο πρόβλημα του αντιβιοτικό αντίσταση, συμπεριλαμβανομένης μιας επισκόπησης, των αιτιών και του τρόπου προστασίας σας από θανατηφόρες λοιμώξεις.
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Το Chiro.Org είναι η πρόσβασή σας σε ειδήσεις χειροπρακτικής, άρθρα, έρευνα, ασθενή. Η πρόκληση του Αντιβιοτικό Αντίσταση. Αυτή η ενότητα διατηρείται από τον Frank M. .
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Ερωτήσεις και απαντήσεις για αντιβιοτικά και αντιβιοτικό αντίσταση από τη Συμμαχία για τη Συνετή Χρήση των Αντιβιοτικά . Αντιβιοτικό αντίσταση είναι φυσικό.
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Το FDA Consumer αναφέρει ότι αντιβιοτικό αντίσταση γίνεται εφιάλτης δημόσιας υγείας: . Τι είναι αντιβιοτικό αντίσταση & γιατί είναι πρόβλημα; .
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Διαβάστε για την αύξηση αντιβιοτικό αντίσταση σε βακτήρια που προκαλούν ασθένειες στο RxList. . Battle of the Bugs: Fighting Αντιβιοτικό Αντίσταση. Της Λίντα Μπρεν.
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Η ανάπτυξη της αντίσταση στα φάρμακα που χρησιμοποιούνται συνήθως για τη θεραπεία της ελονοσίας είναι του . διαθέσιμα φάρμακα, αυξάνοντας έτσι το φάσμα μιας μετα-αντιβιοτικό εποχή. .
Ολόκληρο το άρθρο >>>

φόβοι άνθρακα οδηγούν σε υπερβολική χρήση του αντιβιοτικά, αντίσταση φοβάται. αντλήστε το αντιβιοτικό από το κελί. Μηχανισμοί των αντίσταση .
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Αντίσταση συμβαίνει γρήγορα, παράλληλα με τη χρήση του αντιβιοτικά. . αντίσταση στο αντιβιοτικό αμπικιλλίνη κατά τη διάρκεια μεταφοράς γονιδίου από Escherichia.
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Αύξηση της συχνότητας των αντιβιοτικό αντίσταση στα βακτήρια από τη δεκαετία του 1950 έχει παρατηρηθεί για όλες τις μεγάλες κατηγορίες των αντιβιοτικά χρησιμοποιείται για τη θεραπεία μιας ευρείας .
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Διαβάστε περισσότερα για αντιβιοτικό αντίσταση στο PBS και στο FDA. Και μάθετε τι μπορείτε να κάνετε αντιβιοτικό αντίσταση σε άλλη σελίδα PBS. .
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Το αυξανόμενο πρόβλημα του αντιβιοτικό αντίσταση: είμαστε στα πρόθυρα μιας ιατρικής καταστροφής; . στα PBPs και την ανάπτυξη των αντιβιοτικό αντίσταση.5 .
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Αντιβιοτικό αντίσταση είναι η ικανότητα ενός βακτηριακού κυττάρου να . αντιβιοτικό αντίσταση . Απόκτηση αντιβιοτικό αντίσταση εμφανίζεται όταν γενετικό υλικό .
Ολόκληρο το άρθρο >>>

. προκαλείται από βακτήρια που αναπτύσσονται γρήγορα αντίσταση σε ένα single αντιβιοτικό . Αντιβιοτικό . έχουν επίσης αναπτυχθεί αντίσταση προς το αντιβιοτικά. Φώτα της δημοσιότητας για τη γήρανση.
Ολόκληρο το άρθρο >>>

Αντιβιοτικό αντίσταση είναι αρκετά διαδεδομένο και δεν περιορίζεται σε τέτοιες ρυθμίσεις. . Η πρόκληση του Αντιβιοτικό Αντίσταση .
Ολόκληρο το άρθρο >>>


Πώς συμβαίνει η ανθεκτικότητα στα αντιβιοτικά

Τα αντιβιοτικά σώζουν ζωές, αλλά κάθε φορά που χρησιμοποιούνται αντιβιοτικά, μπορεί να προκαλέσουν παρενέργειες και να οδηγήσουν σε αντίσταση στα αντιβιοτικά.

Από τη δεκαετία του 1940, τα αντιβιοτικά έχουν μειώσει σημαντικά τις ασθένειες και τους θανάτους από μολυσματικές ασθένειες. Ωστόσο, καθώς χρησιμοποιούμε τα φάρμακα, τα μικρόβια αναπτύσσουν αμυντικές στρατηγικές εναντίον τους. Αυτό καθιστά τα φάρμακα λιγότερο αποτελεσματικά.

Τα αντιμικροβιακά θεραπεύουν τις λοιμώξεις που προκαλούνται από μικρόβια

Τα μικρόβια είναι πολύ μικροί ζωντανοί οργανισμοί, όπως τα βακτήρια. Τα περισσότερα μικρόβια είναι αβλαβή και ακόμη και χρήσιμα για τον άνθρωπο, αλλά μερικά μπορεί να προκαλέσουν λοιμώξεις και ασθένειες. Τα φάρμακα που χρησιμοποιούνται για τη θεραπεία αυτών των λοιμώξεων ονομάζονται αντιμικροβιακά. Το πιο γνωστό αντιμικροβιακό είναι τα αντιβιοτικά, τα οποία σκοτώνουν ή σταματούν την ανάπτυξη βακτηρίων.

Δύο είδη μικροβίων

  • Τα βακτήρια προκαλούν ασθένειες όπως ο στρεπτόκοκκος στο λαιμό και η τροφική δηλητηρίαση. Οι βακτηριακές λοιμώξεις αντιμετωπίζονται με φάρμακα που ονομάζονται αντιβιοτικά (όπως η πενικιλίνη).
  • Οι μύκητες προκαλούν ασθένειες όπως λοιμώξεις ποδιών αθλητών και ζύμης. Οι μυκητιασικές λοιμώξεις αντιμετωπίζονται με φάρμακα που ονομάζονται αντιμυκητιακά.

Πώς τα μικρόβια γίνονται ανθεκτικά και εξαπλώνονται

  1. Τα μικρόβια (βακτήρια και μύκητες) υπάρχουν παντού. Κάποιοι μας βοηθούν. Μερικοί αρρωσταίνουν ανθρώπους, καλλιέργειες ή ζώα. Μερικά από αυτά τα μικρόβια είναι ανθεκτικά στα αντιβιοτικά.
  2. Τα αντιβιοτικά σκοτώνουν τα μικρόβια που προκαλούν λοιμώξεις. Όμως τα μικρόβια που είναι ανθεκτικά στα αντιβιοτικά βρίσκουν τρόπους να επιβιώσουν. Τα αντιβιοτικά σκοτώνουν επίσης τα καλά βακτήρια που προστατεύουν τον οργανισμό από μόλυνση.
  3. Τα μικρόβια που είναι ανθεκτικά στα αντιβιοτικά μπορούν να πολλαπλασιαστούν. Μερικά ανθεκτικά μικρόβια μπορούν επίσης να δώσουν την αντίστασή τους απευθείας σε άλλα μικρόβια.
  4. Μόλις εμφανιστεί η αντίσταση στα αντιβιοτικά, μπορεί να εξαπλωθεί σε νέα περιβάλλοντα και μεταξύ χωρών.

Στρατηγικές άμυνας μικροβίων

Τα αντιβιοτικά καταπολεμούν τα μικρόβια (βακτήρια και μύκητες). Όμως τα μικρόβια αντεπιτίθενται και βρίσκουν νέους τρόπους επιβίωσης. Οι αμυντικές τους στρατηγικές ονομάζονται μηχανισμοί αντίστασης. Τα βακτήρια αναπτύσσουν μηχανισμούς αντίστασης χρησιμοποιώντας οδηγίες που παρέχονται από το DNA τους. Συχνά, γονίδια αντίστασης βρίσκονται μέσα σε πλασμίδια, μικρά κομμάτια DNA που μεταφέρουν γενετικές οδηγίες από το ένα μικρόβιο στο άλλο. Αυτό σημαίνει ότι ορισμένα βακτήρια μπορούν να μοιράζονται το DNA τους και να κάνουν άλλα μικρόβια να γίνουν ανθεκτικά.

Παραδείγματα αμυντικών στρατηγικών για μικρόβια

Τα μικρόβια μπορούν να χρησιμοποιήσουν αμυντικές στρατηγικές για να αντισταθούν στις επιπτώσεις των αντιβιοτικών. Εδώ είναι μερικά παραδείγματα.

Μηχανισμοί Αντίστασης (Στρατηγικές Άμυνας)
Μηχανισμοί Αντίστασης
(Στρατηγικές άμυνας)
Περιγραφή
Περιορίστε την πρόσβαση στο αντιβιοτικό Τα μικρόβια περιορίζουν την πρόσβαση αλλάζοντας τις εισόδους ή περιορίζοντας τον αριθμό των εισόδων.

Παράδειγμα: Τα Gram-αρνητικά βακτήρια έχουν ένα εξωτερικό στρώμα (μεμβράνη) που τα προστατεύει από το περιβάλλον τους. Αυτά τα βακτήρια μπορούν να χρησιμοποιήσουν αυτή τη μεμβράνη για να εμποδίσουν επιλεκτικά την είσοδο αντιβιοτικών φαρμάκων.

Παράδειγμα: Μερικοί Pseudomonas aeruginosa Τα βακτήρια μπορούν να παράγουν αντλίες για να απαλλαγούν από πολλά διαφορετικά σημαντικά αντιβιοτικά φάρμακα, συμπεριλαμβανομένων των φθοριοκινολόνων, των βήτα-λακταμών, της χλωραμφενικόλης και της τριμεθοπρίμης.

Παράδειγμα: Klebsiella pneumoniae τα βακτήρια παράγουν ένζυμα που ονομάζονται καρβαπενεμάσες, τα οποία διασπούν τα φάρμακα καρβαπενέμης και τα περισσότερα άλλα φάρμακα βήτα-λακτάμης

Παράδειγμα: Μερικοί Η ασθένεια του σταφυλοκοκου τα βακτήρια μπορούν να παρακάμψουν τις δράσεις του φαρμάκου της τριμεθοπρίμης

Παράδειγμα: Escherichia coli βακτήρια με το mcr-1 γονίδιο μπορεί να προσθέσει μια ένωση στο εξωτερικό του κυτταρικού τοιχώματος έτσι ώστε το φάρμακο κολιστίνη να μην μπορεί να κολλήσει πάνω του.


Βακτηριακή αντοχή στα αντιβιοτικά

  • Βανκομυκίνη (απομονωμένο από το έδαφος) και τεϊκοπλανίνη είναι τα δύο πιο γνωστά γλυκοπεπτίδια και τα νέα ημισυνθετικά γλυκοπεπτίδια νταλμπαβανκίνη, οριταβανκίνη, και τελαβανκίνη χρησιμοποιούνται κλινικά.
  • Είναι ως επί το πλείστον δραστικά έναντι των θετικών κατά Gram βακτηρίων και συνδέονται με τις τερματικές πλευρικές αλυσίδες της πεπτιδογλυκάνης Dalanyl-D-αλανίνης και αποτρέπουν τη διασταυρούμενη σύνδεση στο κυτταρικό τοίχωμα.
  • Η εξωτερική μεμβράνη δρα ως περιορισμός για να δράσουν αυτά τα αντιβιοτικά ενάντια στα gram-αρνητικά βακτήρια.
  • Η αντίσταση σε αυτά τα αντιβιοτικά παρατηρήθηκε για πρώτη φορά στη βανκομυκίνη μεταξύ των εντερόκοκκων κυρίως σε E.faecium και E.faecalis και Staphylococcus aureus.
  • Τα γλυκοπεπτιδικά αντιβιοτικά είναι τετρακυκλικές ενώσεις με έναν πυρήνα που αποτελείται από επτά αμινοξέα (επταπεπτίδιο) στα οποία συνδέονται δύο τμήματα σακχάρου.

Βανκομυκίνη

Τρόπος δράσης της Βανκομυκίνης

  • Η βανκομυκίνη αναστέλλει τη σύνθεση του κυτταρικού τοιχώματος αναστέλλοντας τις πρόδρομες ουσίες πεπτιδογλυκάνης (κυτταρικό τοίχωμα) σχηματίζοντας ένα σταθερό, μη ομοιοπολικό σύμπλοκο με το C-τερματικό D-Ala-D-Ala των μονομερών μουρεΐνης.
  • Αυτά τα μονομερή D-Ala-D-Ala άκρο του συνδετήρα πεπτιδογλυκάνης πενταπεπτιδίου συγκρατούνται από πέντε δεσμούς υδρογόνου.
  • Αυτό οδηγεί στην αναστολή της διασύνδεσης στην πεπτιδογλυκάνη, αναστέλλοντας έτσι τη σύνθεση του κυτταρικού τοιχώματος και ταυτόχρονα προκαλεί μια διαμορφωτική αλλαγή που μπλοκάρει το ένζυμο γλυκοζυλοτρανσφεράση.
  • Αυτό έχει ως αποτέλεσμα την αναστολή της τρανσγλυκοζυλίωσης, σταματώντας έτσι την ανάπτυξη πεπτιδογλυκάνης εμποδίζοντας την προσθήκη Ν-ακετυλομουραμικού και οξέος και Ν-ακετυλογλυκοζαμίνης στην αναπτυσσόμενη αλυσίδα.

Βακτηριοκτόνος δράση της βανκομυκίνης σε gram-θετικά βακτήρια

Αντοχή στη Βανκομυκίνη

  • Συχνή χρήση βανκομυκίνης από το στόμα για λοιμώξεις από Clostridium difficile και βανκομυκίνης για MRSA, οι εντερόκοκκοι συμπεριλαμβανομένων των στελεχών E. faecium και του E. faecalis ανέπτυξαν σύντομα αντοχή στη βανκομυκίνη και την τεϊκοπλανίνη.
  • Οι ανθεκτικοί στη βανκομυκίνη εντερόκοκκοι (VRE) είναι η αιτία για περισσότερο από το 20% όλων των εντεροκοκκικών λοιμώξεων.
  • Η αντίσταση έναντι αυτών των αντιβιοτικών εμφανίστηκε όταν το βακτήριο απέκτησε και εξέφρασε οπερόνια που υποκαθιστούν ένα τερματικό D-γαλακτικό (D-Lac) ή D-σερίνη (D-Ser) για το τερματικό D-Ala σε πρόδρομες ενώσεις πεπτιδογλυκάνης.
  • Αυτή η αντικατάσταση οδηγεί σε 1000 φορές μείωση της συγγένειας της βανκομυκίνης λόγω της απώλειας ενός από τους πέντε δεσμούς υδρογόνου που συγκρατούσαν το D-Ala-D-Ala των μονομερών μουρεΐνης (πρόδρομοι πεπτιδογλυκάνης).
  • Επτά οπερόνια ή συστάδες γονιδίων που έχουν αναφερθεί (vanA, vanB, vanC, vanD, vanE, vanG και vanL).
  • Οι εντερόκοκκοι με το γονίδιο vanA προσδίδουν υψηλή αντοχή τόσο στη βανκομυκίνη όσο και στην τεϊκοπλανίνη
  • Αντίθετα, οι εντερόκοκκοι vanB διατηρούν την ευαισθησία στην τεϊκοπλανίνη και είναι ανθεκτικοί μόνο στη βανκομυκίνη
  • Η αντοχή στο VanC είναι εγγενής και κωδικοποιείται χρωμοσωμικά σε ορισμένα είδη εντερόκοκκου όπως το E.
    gallinarum και ο πρόδρομος πεπτιδογλυκάνης είναι D-Ala-D-Ser.
  • Αντίσταση VanD και VanE, αλλά και τα δύο είναι επίκτητα. VanD χρήσεις Το D-Ala-D-Lac και το VanE χρησιμοποιεί το D-Ala-D-Ser.

MRSA και μειωμένη ευαισθησία στα γλυκοπεπτίδια

  • Οι εντερόκοκκοι είναι εγγενώς ανθεκτικοί σε πολλαπλές κατηγορίες αντιβιοτικών και μπορούν να αποκτήσουν πρόσθετους μηχανισμούς αντίστασης που τους καθιστούν δεξαμενές γονιδίων μικροβιακής αντοχής.
  • Το MRSA ή ο ανθεκτικός στα μεθυλικά Staphylococcus aureus είναι ανθεκτικός λόγω αντοχής τύπου VanA.
  • Προκαλείται επίσης από τα οπερόνια αντίστασης.

Αμινογλυκοσιδικά αντιβιοτικά

  • Αντιβιοτικά αμινογλυκοσίδης (AG). χρησιμοποιούνται για τη θεραπεία πολλών Gram-αρνητικών και ορισμένων Gram-θετικών λοιμώξεων και, πολυανθεκτικής φυματίωσης.
  • Η αντίσταση στα AG προκύπτει μέσω μιας ποικιλίας εγγενών και επίκτητων μηχανισμών.
  • Τα AG έχουν εξεταστεί ως πιθανές θεραπείες για μυκητιάσεις, παρασιτικές λοιμώξεις από λεϊσμανίαση και για γενετικές ασθένειες που προκύπτουν από κωδικόνια πρόωρης λήξης, όπως η κυστική ίνωση, το σύνδρομο Rett και η μυϊκή δυστροφία Duchenne
  • Τα AG ασκούν την αντιβακτηριδιακή τους δράση δεσμεύοντας το βακτηριακό ριβόσωμα και παρεμβαίνοντας στη μετάφραση των βακτηριακών πρωτεϊνών.

Αντοχή στα αμινογλυκοσιδικά αντιβιοτικά

  • Οι αμινογλυκοσίδες είναι υδρόφιλα σάκχαρα που διαθέτουν έναν αριθμό αμινο και υδροξυ υποκαταστατών.
  • Το βακτηριακό ριβόσωμα αποτελείται από υπομονάδες 70S, δηλαδή υπομονάδες 50S και 30S και η μετάφραση πρωτεΐνης λαμβάνει χώρα σε 3 θέσεις – θέσεις E, P, A
  • Οι ομάδες αμίνης του AG πρωτονιώνονται σε βιολογικό pH και έχει υψηλή συγγένεια για τα νουκλεϊκά οξέα, ιδιαίτερα τη θέση δέκτη (Α) του 16S ριβοσωμικού RNA.
  • Η δέσμευση αμινογλυκοσίδης στη θέση Α παρεμβαίνει στην ακριβή αναγνώριση του συγγενούς tRNA από το rRNA κατά τη μετάφραση και μπορεί επίσης να διαταράξει τη μετατόπιση του tRNA από τη θέση Α στη θέση πεπτιδυλ-tRNA (θέση Ρ).
  • Επίσης, η θέση δέσμευσης AG μπορεί να τροποποιηθεί ενζυματικά από 16S ριβοσωμικό RNA μεθυλτρανσφεράσες. Πρώην- ακτινομύκητες
  • Τα βακτήρια που έχουν μολυνθεί από αυτό το αντιβιοτικό μπορεί να αντιστέκονται στον εαυτό τους παράγοντας RMTases για να μεθυλιώσουν το δικό τους 16S rRNA.
  • Ο πιο κοινός μηχανισμός για την αντίσταση των αμινογλυκοσιδών είναι η χημική τροποποίηση από τα ένζυμα που ονομάζονται ένζυμα τροποποίησης αμινογλυκοσιδίων (AMEs) γεγονός που θέτει σε κίνδυνο την ικανότητά τους να αλληλεπιδρούν με το rRNA.
  • Υπάρχουν τρεις κατηγορίες αυτών των ενζύμων: αμινογλυκοσιδικές φωσφατάσες (APHs),
    αμινογλυκοσιδικές νουκλεοτιδυλτρανσφεράσες (ANTs)και αμινογλυκοσιδικές ακετυλοτρανσφεράσες (AACs).
  • Κάθε AME τροποποιεί ένα AG σε μια συγκεκριμένη θέση που οδηγεί σε ορισμένες δομικές τροποποιήσεις.

Αντιβιοτικά τετρακυκλίνης

  • Αντιβιοτικά τετρακυκλίνης είναι αποτελεσματικά κατά των θετικών και αρνητικών κατά Gram βακτηρίων, σπειροχαιτών, υποχρεωτικών ενδοκυτταρικών βακτηρίων, καθώς και πρωτόζωων παρασίτων.
  • Οι τετρακυκλίνες συνδέονται με βακτηριακά ριβοσώματα και αλληλεπιδρούν με τον στόχο 16S ριβοσωμικού RNA (rRNA) στη ριβοσωμική υπομονάδα 30S, αναστέλλοντας τη μετάφραση παρεμβαίνοντας στη σύνδεση του RNA μεταφοράς αμινοακυλίου (tRNA) κατά την επιμήκυνση
  • Χλορτετρακυκλίνη και οξυτετρακυκλίνη είναι κλινικά χρησιμοποιούμενα αντιβιοτικά τετρακυκλίνης.

Αντοχή στα αντιβιοτικά τετρακυκλίνης

  • Αλλά αντίσταση έχει παρατηρηθεί σε πολλά είδη συμπεριλαμβανομένης της Escherichiacoli,Κλεμπσιέλλα είδος, ανθεκτικό στη μεθικιλλίνη Η ασθένεια του σταφυλοκοκου (MRSA), και Streptococcus pneumoniae
  • Η αντίσταση χαρακτηρίστηκε λόγω της εκροής, της ριβοσωμικής προστασίας και της ενζυμικής αδρανοποίησης των φαρμάκων τετρακυκλίνης.
  • Τα περισσότερα βακτήρια έχουν πολλαπλά αντίγραφα rRNA τα οποία προσδίδουν μετάλλαξη με βάση τον στόχο με χαμηλό αριθμό αντιγράφων γονιδίου rRNA που οδηγεί σε αντίσταση των αντιβιοτικών.
  • Σε αντίθεση με τα γονίδια rRNA, τα γονίδια που κωδικοποιούν τις ριβοσωμικές πρωτεΐνες είναι μεμονωμένα αντίγραφα και οι μεταλλάξεις σε αυτά τα γονίδια μπορούν να προσδώσουν αντίσταση στα αντιβιοτικά.
  • Οι πιο κοινές ειδικές για την τετρακυκλίνη αντλίες εκροής είναι μέλη της κύριας υπεροικογένειας διευκολυντών (MFS) των μεταφορέων.
  • Αυτές οι πρωτεΐνες (MFS) ανταλλάσσουν ένα πρωτόνιο με ένα σύμπλεγμα τετρακυκλίνης-κατιόντος (συνήθως Mg2+),
    μείωση της ενδοκυτταρικής συγκέντρωσης φαρμάκου και προστασία των ριβοσωμάτων-στόχων στο κύτταρο.
  • Η δέσμευση φαρμάκου μεταβάλλει τη διαμόρφωση του καταστολέα που δεν επιτρέπει τη δέσμευση της περιοχής χειριστή του DNA και τον αποκλεισμό της μεταγραφής και είναι εφαρμόσιμη σε όλα τα Gram-αρνητικά συστήματα εκροής.

Αντιβιοτικά φθοριοκινολόνης

  • Κινολόνες είναι μια ευρέως χρησιμοποιούμενη κατηγορία συνθετικών αντιμικροβιακών που χρησιμοποιούνται τόσο στην ανθρώπινη όσο και στην κτηνιατρική ιατρική.
  • Οι κινολόνες είναι αντιβιοτικά ευρέος φάσματος που είναι δραστικά έναντι τόσο των θετικών κατά Gram όσο και των αρνητικών κατά Gram βακτηρίων, συμπεριλαμβανομένων των μυκοβακτηρίων και των αναερόβιων.
  • Χλωροκίνη, ένα από τα αντιβιοτικά χρησιμοποιούνται στη θεραπεία λοιμώξεων του ουροποιητικού συστήματος
  • Οι φθοροκινολόνες αναστέλλουν επιλεκτικά τη σύνθεση βακτηριακών νουκλεϊκών οξέων διαταράσσοντας το ένζυμο τοποϊσομεράσες II και IV και τη γυράση του DNA

Αντοχή στα αντιβιοτικά φθοριοκινολόνης

  • Φθοροκινολόνες δεσμεύουν και αναστέλλουν δύο βακτηριακά ένζυμα τοποϊσομεράσης: τη γυράση DNA (τοποϊσομεράση II) που απαιτείται για την υπερέλιξη του DNA και την τοποϊσομεράση IV που απαιτείται για τον διαχωρισμό των κλώνων κατά τη διαίρεση των κυττάρων.
  • Η DNA γυράση αποτελείται από 2 GyrA και 2 GyrB υπομονάδες και η τοποϊσομεράση IV που αποτελείται από 2 ParC και 2 ParE υπομονάδες.
  • Η γυράση DNA στοχεύει αρνητικά κατά Gram βακτήρια, ενώ και οι δύο τοποϊσομεράσες αναστέλλονται σε
    Gram-θετικά βακτήρια.
  • Μεταλλάξεις στο gyrA, που περιλαμβάνουν ιδιαίτερα την υποκατάσταση μιας ομάδας υδροξυλίου με μια ογκώδη υδρόφοβη ομάδα που οδηγεί σε αλλαγές διαμόρφωσης που αναστέλλουν τη δέσμευση της φθοροκινολόνης.
  • Αλλαγές που αφορούν Ser80 και Glu84 του S. aureus grlA και Ser79 και Asp83 του S. pneumoniae
    Το parC οδήγησε σε αντίσταση στην κινολόνη.
  • Οι τοποϊσομεράσες βρίσκονται στο κυτταρόπλασμα και έτσι οι φθοροκινολόνες πρέπει να διασχίσουν το κυτταρικό περίβλημα για να φτάσουν στον στόχο τους, ο οποίος παρέχει αντίσταση στα Gram-αρνητικά βακτήρια.
  • Ο μηχανισμός εκροής τείνει να λειτουργεί για χαμηλά επίπεδα θετικών και αρνητικών κατά Gram βακτηρίων.
  • Η έκφραση NorA προσδίδει αντοχή σε υδρόφιλες κινολόνες, όπως η νορφλοξασίνη και η σιπροφλοξασίνη, ενώ η έκφραση NorB και NorC προσδίδει αντοχή σε υδρόφιλες κινολόνες και υδρόφοβες κινολόνες, όπως π.χ. σπαρφλοξασίνη και μοξιφλοξασίνη.
  • Οι φθοροκινολόνες χρησιμοποιούνται για τη θεραπεία του Mycobacterium avium και του πολυανθεκτικού M. tuberculosis και έχει εντοπιστεί αντίσταση που προκαλείται από εκροή.
  • Ένας αριθμός αντλιών εκροής έχει εντοπιστεί μεταξύ των αρνητικών κατά Gram βακτηρίων, συμπεριλαμβανομένου του AcrA στο E. coli, το οποίο ρυθμίζεται εν μέρει από την πολλαπλή αντοχή στα αντιβιοτικά

Χλωραμφενικόλη

  • Χλωραμφενικόλη είναι ένα αντιβιοτικό ευρέος φάσματος κατά αρκετών gram-θετικών και gram-αρνητικών βακτηρίων, σπειροχαιτών και Rickettsiae.
  • Αναστέλλει τη μετάφραση του mRNA δεσμεύοντας στα 70S ριβοσώματα των προκαρυωτικών αλλά δεν επηρεάζει τα ευκαρυωτικά ριβοσώματα 80S.
  • Η χλωραμφενικόλη είναι λιποδιαλυτή που τις αφήνει να διαχυθούν μέσω της βακτηριακής κυτταρικής μεμβράνης και δεσμεύονται αναστρέψιμα στη βακτηριακή ριβοσωμική υπομονάδα 50S.
  • Η δέσμευση παρεμβαίνει στη δραστηριότητα της πεπτιδυλ τρανσφεράσης εμποδίζοντας τη μεταφορά αμινοξέων στις αναπτυσσόμενες πεπτιδικές αλυσίδες και εμποδίζει το σχηματισμό πεπτιδικού δεσμού που εμποδίζει τη σύνθεση βακτηριακών πρωτεϊνών.

Αντοχή στη χλωραμφενικόλη

  • Αντοχή στη χλωραμφενικόλη (Cmr) μεταφερόταν στο πλασμίδιο και η αντίσταση οφείλεται στην παρουσία ενός ενζύμου, ακετυλοτρανσφεράση χλωραμφενικόλης (CAT), η οποία καταλύει την εξαρτώμενη από ακετυλ-CoA ακετυλίωση του αντιβιοτικού στην ομάδα υδροξυλίου C-3 και μερικές φορές με φωσφοτρανσφεράσες χλωραμφενικόλης
  • Οι ακετυλοτρανσφεράσες χλωραμφενικόλης (CATs) απενεργοποιούν τη χλωραμφενικόλη. Το Cmr μπορεί επίσης να οφείλεται στην εκροή χλωραμφενικόλης μέσω συγκεκριμένων μεταφορέων που σχετίζονται με τη μεμβράνη.
  • Το Cmr μπορεί επίσης να εμφανιστεί από μεταλλάξεις που μειώνουν τη διαπερατότητα των πρωτεϊνών της εξωτερικής μεμβράνης, μεταλλάξεις στο 23S rRNA ή τροποποίηση της θέσης στόχου από μια μεθυλάση 23S rRNA.

Αντιβιοτικά οξαζολιδινόνης

  • Linezolid είναι η πρώτη διαθέσιμη οξαζολιδινόνη.
  • Συμμετέχει στη θεραπεία επιπλεγμένων δερματικών λοιμώξεων που προκαλούνται από ανθεκτικό στη μεθικιλλίνη S.
    (MRSA), νοσοκομειακή πνευμονία που προκαλείται από MRSA, ταυτόχρονη βακτηριαιμία που σχετίζεται με ανθεκτικό στη βανκομυκίνη Enterococcus faecium και ταυτόχρονη βακτηριαιμία που σχετίζεται με πνευμονία της κοινότητας που προκαλείται από ανθεκτικό στην πενικιλλίνη S. pneumoniae.
  • Οι οξαζολιδινόνες συνδέονται με τη ριβοσωμική υπομονάδα 50S και δεν έχουν καμία συγγένεια με την υπομονάδα 30S

Αντοχή στα αντιβιοτικά οξαζολιδινόνης

  • Η μειωμένη συγγένεια του ριβοσώματος για τις οξαζολιδινόνες λόγω μεταλλάξεων στον κεντρικό βρόχο του τομέα V του συστατικού 23S rRNA είναι η αιτία της αντίστασης σε αυτά τα φάρμακα
  • Η ριβοσωμική αντίσταση στις οξαζολιδινόνες φάνηκε σε μεταλλάγματα ανθεκτικά στην οξαζολιδινόνη με ριβοσωμική δέσμευση και in vitro μελέτες μετάφρασης

Αντιβιοτικά μακρολίδης, λινκοσαμίδης και στρεπτογραμμίνης (MLS).

  • Αυτά τα μέλη της ομάδας αντιβιοτικών MLS αναστέλλουν τη βακτηριακή πρωτεϊνική σύνθεση δεσμεύοντας σε μια θέση στόχο στο ριβόσωμα.
  • Τα Gram-αρνητικά βακτήρια είναι ανθεκτικά λόγω του φραγμού διαπερατότητας της εξωτερικής μεμβράνης.
  • Η ασθένεια του σταφυλοκοκου (S. aureus) θεωρείται ως το παθογόνο που αποκτά αντίσταση σε ορισμένα αντιβιοτικά.

Αντοχή στα αντιβιοτικά μακρολίδης, λινκοσαμίδης και στρεπτογραμμίνης (MLS)

  • Τρεις μηχανισμοί είναι υπεύθυνοι για την απόκτηση αντοχής στα αντιβιοτικά MLS στους σταφυλόκοκκους: (1) τροποποιήσεις της θέσης στόχου με μεθυλίωση ή μετάλλαξη (2) ενεργή εκροή αντιβιοτικών ή (3) αδρανοποίηση αντιβιοτικών.
  • Οι τροποποιήσεις της θέσης στόχου με μεθυλίωση ή μετάλλαξη περιλαμβάνουν τροποποιήσεις της θέσης στόχου από μια μεθυλάση που κωδικοποιείται από ένα ή περισσότερα από τα εμμ γονίδια, μεθυλιώνοντας το 23S rRNA και ως εκ τούτου αλλάζοντας τις θέσεις δέσμευσης για τα αντιβιοτικά MLS
  • Η ενεργός εκροή αντιβιοτικών περιλαμβάνει μια αντλία εκροής μακρολιδίων που κωδικοποιείται από τα γονίδια msr(A) και/ή msr(B)
  • Ένας τρίτος μηχανισμός αντίστασης, που περιλαμβάνει ριβοσωμική μετάλλαξη, έχει αναφερθεί σε ένα μικρό
    ένας αριθμός κλινικών απομονώσεων του S. pneumoniae.

Τριμεθοπρίμη

  • Η τριμεθοπρίμη χρησιμοποιείται για τη θεραπεία λοιμώξεων του εντέρου, του αναπνευστικού, του δέρματος και του ουροποιητικού συστήματος
  • Δρα βακτηριοστατικά αναστέλλοντας το διυδροφολική αναγωγάση (DHFR).

Αντοχή στην τριμεθοπρίμη

(ii) μια φυσικά μη ευαίσθητη εγγενής διϋδροφολική αναγωγάση (DHFR)

(iii) αυθόρμητες μεταλλάξεις στην εγγενή DHFR

(iv) αυξημένη παραγωγή του ευαίσθητου ενζύμου στόχου με αυξημένη ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης ή γονιδιακό διπλασιασμό

(v) οριζόντια απόκτηση (με τη μεσολάβηση πλασμιδίου ή σύζευξη) του dfr γονίδια που κωδικοποιούν ανθεκτικά DHFR.


ΥΠΕΡΒΑΘΜΙΑ ΚΑΙ ΥΠΕΡΑΝΤΟΧΗ

Πολλά από τα βακτηριακά παθογόνα που σχετίζονται με επιδημίες ανθρώπινων ασθενειών έχουν εξελιχθεί σε πολυανθεκτικές μορφές (MDR) μετά τη χρήση αντιβιοτικών. Για παράδειγμα, MDR Μ. tuberculosis είναι ένα σημαντικό παθογόνο που βρέθηκε τόσο σε αναπτυσσόμενες όσο και σε βιομηχανικές χώρες και έγινε η εκδοχή του 20ου αιώνα ενός παλαιού παθογόνου. Άλλες σοβαρές λοιμώξεις περιλαμβάνουν νοσοκομειακές (συνδεδεμένες με το νοσοκομείο) λοιμώξεις με Acinetobacter baumanniΕγώ, Burkholderia cepacia, Campylobacter jejuni, Citrobacter freundii, Clostridium difficile, Εντεροβακτηρίδιο spp., Enterococcus faecium, Enterococcus faecalis, Escherichia coli, Haemophilus influenzae, Klebsiella pneumoniae, Πρωτεύς mirabilis, Pseudomonas aeruginosa, Σαλμονέλα spp., Σερράτια spp., Staphyloσυνccus aureus, Staphylococcus epidermidis, Stenotrophomonas maltophilia, και Streptococcus pneumoniae. Ο όρος “superbugs” αναφέρεται σε μικρόβια με αυξημένη νοσηρότητα και θνησιμότητα λόγω πολλαπλών μεταλλάξεων που παρέχουν υψηλά επίπεδα αντοχής στις κατηγορίες αντιβιοτικών που συνιστώνται ειδικά για τη θεραπεία τους, οι θεραπευτικές επιλογές για αυτά τα μικρόβια μειώνονται και οι περίοδοι νοσοκομειακής περίθαλψης παρατείνονται και πιο δαπανηρή. Σε ορισμένες περιπτώσεις, τα υπερανθεκτικά στελέχη έχουν επίσης αποκτήσει αυξημένη λοιμογόνο δράση και αυξημένη μεταδοτικότητα. Ρεαλιστικά, η αντίσταση στα αντιβιοτικά μπορεί να θεωρηθεί λοιμογόνος παράγοντας.

Η φυματίωση είναι το αρχετυπικό ανθρώπινο παθογόνο που εξελίχτηκε με την ανθρώπινη φυλή και επί του παρόντος μολύνει έως και το ένα τρίτο του παγκόσμιου πληθυσμού. Ενώ οι πρωτοποριακές ανακαλύψεις της στρεπτομυκίνης και της ισονιαζίδης παρείχαν ζωτικές θεραπείες, η ανάπτυξη αντοχής ήταν ταχεία. Ο Τζορτζ Όργουελ, ο οποίος έπασχε από φυματίωση ενώ έγραφε το μυθιστόρημα 1984, προφανώς μολύνθηκε από ένα ανθεκτικό στα αντιβιοτικά στέλεχος του Μ. tuberculosis (122). Η εισαγωγή κοκτέιλ φαρμάκων κατά της φυματίωσης έχει γίνει ένα βασικό θεραπευτικό σχήμα, με σημαντική επιτυχία, ωστόσο, για διάφορους λόγους, η αντίσταση σε πολλά φάρμακα συνεχίζει να θέτει σε κίνδυνο τη θεραπεία της φυματίωσης σε όλο τον κόσμο. Μ. tuberculosis στελέχη ανθεκτικά σε τέσσερις ή περισσότερες από τις θεραπείες πρώτης γραμμής (δηλαδή, στελέχη [XDR] εξαιρετικά ανθεκτικά στα φάρμακα) εμφανίστηκαν και εξαπλώθηκαν γρήγορα την τελευταία δεκαετία περίπου (124, 130). Και τώρα υπάρχουν στελέχη TDR, τα οποία είναι πλήρως ανθεκτικά στα φάρμακα (143)! Δεν έχουν υπάρξει επικυρωμένες αναφορές για το ρόλο της HGT στην ανάπτυξη αντοχής σε Μ. tuberculosis. Αντοχή στα αντιβιοτικά σε Μ. tuberculosis συμβαίνει αποκλειστικά με αυθόρμητη μετάλλαξη.

Τα επικρατέστερα Gram-αρνητικά παθογόνα, όπως π.χ Escherichia coli, Salmonella enterica, και Klebsiella pneumoniae, προκαλούν μια ποικιλία ασθενειών σε ανθρώπους και ζώα, και μια ισχυρή συσχέτιση μεταξύ της χρήσης αντιβιοτικών στη θεραπεία αυτών των ασθενειών και της ανάπτυξης αντοχής στα αντιβιοτικά έχει παρατηρηθεί τον τελευταίο μισό αιώνα. Αυτό είναι ιδιαίτερα εμφανές με την κατηγορία αντιβιοτικών β-λακτάμης και τα σχετικά αδρανοποιητικά ένζυμα, τις β-λακταμάσες. Αυτή τη στιγμή, έχουν εντοπιστεί αρκετές ομάδες και κατηγορίες, που περιλαμβάνουν έως και 1.000 σχετιζόμενες με την αντοχή β-λακταμάσες (Εικ. ​ (Εικ.2). 2 ). Αυτές περιλαμβάνουν νέες κατηγορίες γονιδίων και τις μεταλλαγμένες ακτινοβολίες τους (28, 78, 86, 112, 116). Η HGT έχει διαδραματίσει κυρίαρχο ρόλο στην εξέλιξη και τη μετάδοση της αντοχής στα αντιβιοτικά β-λακτάμης μεταξύ των εντερικών βακτηρίων τόσο στις λοιμώξεις της κοινότητας όσο και στις νοσοκομειακές λοιμώξεις.

Αριθμοί μοναδικών ενζύμων β-λακταμάσης που εντοπίστηκαν από την εισαγωγή των πρώτων αντιβιοτικών β-λακτάμης. (Οι ενημερωμένοι αριθμοί είναι ευγενική προσφορά της Karen Bush.)

Όσον αφορά τις νοσοκομειακές παθήσεις, Pseudomonas aeruginosa έχει εξελιχθεί από λοίμωξη εγκαυμάτων σε σημαντική νοσοκομειακή απειλή. Και σε αυτή την περίπτωση, πάλι, οι μηχανισμοί αντίστασης στα αντιβιοτικά εξελίχθηκαν συμπτωματικά με την εισαγωγή νέων αντιβιοτικών παραγώγων, θέτοντας σε κίνδυνο τις πιο αποτελεσματικές θεραπείες (όπως τις β-λακτάμες και αμινογλυκοσίδες). P. aeruginosa προκαλεί σημαντική ανησυχία για ασθενείς με κυστική ίνωση (76) το παθογόνο είναι εξαιρετικά επίμονο και μπορεί να αποφύγει την ανθρώπινη ανοσολογική άμυνα. Η ανάπτυξη ανθεκτικότητας σχετίζεται με τη μακροχρόνια αντιβιοτική θεραπεία ασθενών με κυστική ίνωση.

Acinetobacter baumannii είναι πιο πρόσφατο Gram-αρνητικό παθογόνο και είναι επίσης κυρίως νοσοκομειακό. Όπως και με τις ψευδομονάδες, είναι εξοπλισμένο με μια σειρά γονιδίων r και καθοριστικών παραγόντων παθογένειας που οδηγεί σε αυξημένα ποσοστά θνησιμότητας και νοσηρότητας (107). Θεωρείται ότι οι μολυσματικές ιδιότητες του Acinetobacter Οι οργανισμοί προέρχονται από τις ισχυρές τους ικανότητες επιβίωσης και βιοαποδόμησης στο περιβάλλον, επιπλέον, πολλά στελέχη είναι φυσικά ικανά για την πρόσληψη DNA και έχουν υψηλά ποσοστά φυσικού μετασχηματισμού. Α. baumannii εξελίσσεται με ταχείς ρυθμούς Πρόσφατες μελέτες αλληλουχίας γονιδιώματος έδειξαν ότι ορισμένα παράγωγα έχουν τουλάχιστον 28 γονιδιωματικές νησίδες που κωδικοποιούν καθοριστές αντοχής στα αντιβιοτικά περισσότερα από τα μισά από αυτά τα ένθετα κωδικοποιούν επίσης λειτουργίες λοιμογόνου δράσης με τη μορφή συστημάτων έκκρισης τύπου IV (14, 64).

Επί του παρόντος, το πιο διαβόητο υπερμικρόβιο είναι ο θετικός κατά Gram οργανισμός Η ασθένεια του σταφυλοκοκου. Το αν είναι το πιο σοβαρό σούπερ μικροβιο μπορεί να συζητηθεί, αφού αναρωτιέται κανείς σε ποιο βαθμό η κακή του φήμη οφείλεται στην εκτεταμένη δημοσιογραφική του κάλυψη. S. aureus έχει στενή σχέση με την ανθρωπότητα: μεταφέρεται ως ρινικό συστατικό σε 30% του πληθυσμού και η παρουσία του έχει συνδεθεί εδώ και πολύ καιρό με κοινές δερματικές λοιμώξεις όπως οι βράσεις. Δεν έχει την ιστορική φήμη του Μ. tuberculosis, αλλά τα τελευταία χρόνια, αυτό το πολυανθεκτικό παθογόνο έχει αναδειχθεί ως η κύρια νοσοκομειακή λοίμωξη (50). Μετά την ανακάλυψη της πενικιλίνης, φάνηκε ότι S. aureus Οι λοιμώξεις ήταν ελεγχόμενες, ωστόσο, η ανάπαυλα από την αντίσταση ήταν βραχύβια. Η ανακάλυψη ορόσημο και η εισαγωγή της μεθικιλλίνης (του πρώτου σχεδιαστή αντιβιοτικού αντιβιοτικού) το 1959 θεωρήθηκε ότι ήταν μια σίγουρη άμυνα ενάντια στις πενικιλλινάσες, αλλά η εμφάνιση ανθεκτικών στη μεθικιλλίνη S. aureus (MRSA) μέσα σε μόλις 3 χρόνια οδήγησε αναπόφευκτα σε άλλες παραλλαγές ανθεκτικές στα αντιβιοτικά και το ακρωνύμιο υποδηλώνει τώρα πολυανθεκτικό S. aureus. Σχετικά πρόσφατα, το MRSA έχει μετακινηθεί εκτός νοσοκομείου και έχει γίνει ένα σημαντικό παθογόνο που αποκτάται από την κοινότητα (CA), με ενισχυμένα χαρακτηριστικά λοιμογόνου δράσης και μετάδοσης. Το CA-MRSA έχει τις περισσότερες ιδιότητες του MRSA, αν και με διαφορετικές mec συστάδες γονιδίων και έχει αποκτήσει νέα γονίδια παθογονικότητας, όπως το γονίδιο που κωδικοποιεί την κυτταροτοξική λευκοσιδίνη Panton-Valentine (44). Αυτά ρυθμίζονται από καθορισμένα συστήματα σηματοδότησης (101).

Ένας από καιρό αναγνωρισμένος νοσηλευτής, το αναερόβιο που παράγει τοξίνες Clostridium difficile, εντοπίζεται ολοένα και περισσότερο ως αιτία σοβαρών εντερικών λοιμώξεων πρόσφατα, έχουν αναγνωριστεί υπερμολυσματικά στελέχη που παράγουν τοξίνες (80, 145). Ως Gram-θετικός σχηματιστής σπορίων, είναι ανθεκτικός οργανισμός και μεταδίδεται εύκολα από το προσωπικό του νοσοκομείου, στον εξοπλισμό και ως αεροζόλ. Η ανανεωμένη του προβολή θεωρείται το αποτέλεσμα της εκτεταμένης νοσοκομειακής χρήσης αντιβιοτικών όπως οι κεφαλοσπορίνες εκτεταμένου φάσματος, οι νεότερες πενικιλίνες και οι φθοριοκινολόνες που προκαλούν σημαντική εξάντληση της αρνητικής κατά Gram εντερικής μικροχλωρίδας, ενισχύοντας έτσι C. difficile αποικισμός. Με άλλα λόγια, αυτές οι λοιμώξεις είναι το άμεσο αποτέλεσμα της χρήσης αντιβιοτικών.

Τα σούπερ μικρόβια είναι πανταχού παρόντα στη βιόσφαιρα, οι συνέπειές τους επιδεινώνονται πάρα πολύ σε ασταθείς καταστάσεις όπως εμφύλιες αναταραχές, βία, λιμός και φυσικές καταστροφές και, φυσικά, από κακές ή ανύπαρκτες νοσοκομειακές πρακτικές. Τα υπερμικροβιακά δεν είναι οι μοναδικές μικροβιακές απειλές, αλλά αναγνωρίζονται ως οι πιο απειλητικοί όσον αφορά τη νοσηρότητα και τη θνησιμότητα παγκοσμίως. Όσον αφορά τον αριθμό των λοιμώξεων και των συνεπειών, Vibrio cholerae θα πρέπει να βρίσκεται στην κορυφή της λίστας των υπερβλαβών (84). Ενώ ευτυχώς δεν είναι συνηθισμένο στα βιομηχανικά έθνη, V. cholerae είναι ενδημικό στην Ασία και τη Νότια Αμερική.

Όσον αφορά τον παγκόσμιο έλεγχο των ενδημικών και πανδημικών λοιμωδών νόσων, σημαντικό πρόβλημα είναι η διαθεσιμότητα αξιόπιστων συστημάτων για την παρακολούθηση των κρουσμάτων σοβαρών λοιμώξεων. Παρά τις ηρωικές προσπάθειες του Παγκόσμιου Οργανισμού Υγείας, τέτοιες αναφορές είναι ανύπαρκτες σε πολλά μέρη του κόσμου. Η έλλειψη πληροφοριών σχετικά με τα πρώιμα στάδια μιας επιδημικής βακτηριακής λοίμωξης έχει καθυστερήσει την κατάλληλη επανορθωτική δράση σε πολλές περιπτώσεις.


Μηχανισμοί αντίστασης

Υπάρχουν διάφοροι γενετικοί μηχανισμοί με τους οποίους μπορεί να αναπτυχθεί αντίσταση στα αντιβιοτικά στα βακτήρια. Αυτοί οι μηχανισμοί προκαλούν αντίσταση επειδή οδηγούν σε βιοχημικές τροποποιήσεις που μεταβάλλουν ορισμένες ιδιότητες βακτηριακών κυττάρων που κανονικά καθιστούν το κύτταρο ευαίσθητο σε ένα αντιβιοτικό. Παραδείγματα βιοχημικών τροποποιήσεων που οδηγούν σε αντίσταση περιλαμβάνουν την παραγωγή ενζύμων που αδρανοποιούν το φάρμακο, την αλλοίωση της πρωτεΐνης, του ενζύμου ή του υποδοχέα που στοχεύει το φάρμακο, την ενεργοποίηση αντλιών εκροής φαρμάκου που απομακρύνουν σκόπιμα το φάρμακο από το κύτταρο και την αλλοίωση του κυττάρου -πρωτεΐνες τοιχώματος που αναστέλλουν την πρόσληψη του φαρμάκου.

Υπάρχουν δύο σημαντικοί τύποι γενετικών μηχανισμών που μπορούν να προκαλέσουν αντίσταση στα αντιβιοτικά: η μετάλλαξη και η απόκτηση νέου γενετικού υλικού. Στην περίπτωση της μετάλλαξης, ο ρυθμός με τον οποίο αναπτύσσεται αντίσταση μπορεί να αποδοθεί στον ρυθμό με τον οποίο μεταλλάσσονται τα βακτήρια. Μια μετάλλαξη είναι μια μόνιμη αλλαγή στο γενετικό υλικό ενός οργανισμού. Οι μεταλλάξεις συμβαίνουν φυσικά όταν τα κύτταρα διαιρούνται. Τα βακτήρια είναι ιδιαίτερα επιρρεπή σε μετάλλαξη επειδή το γονιδίωμά τους αποτελείται από ένα μόνο χρωμόσωμα και επειδή έχουν υψηλό ρυθμό αντιγραφής. Όσο περισσότερες επαναλήψεις υφίσταται ένα κύτταρο, τόσο μεγαλύτερη είναι η πιθανότητα να μεταλλαχθεί. Η απόκτηση νέου γενετικού υλικού είναι επίσης μια φυσική διαδικασία στα βακτήρια. Αυτή η διαδικασία φαίνεται να είναι ο πιο συνηθισμένος μηχανισμός με τον οποίο αναπτύσσεται αντίσταση, διευκολύνεται από το γεγονός ότι τα βακτήρια είναι προκαρυωτικοί οργανισμοί (που σημαίνει ότι δεν έχουν πυρήνα που προστατεύει το γονιδίωμα) και από την παρουσία μικρών κομματιών DNA που ονομάζονται πλασμίδια που υπάρχουν σε ένα βακτηριακό κύτταρο χωριστό από το χρωμόσωμα. Έτσι, το γενετικό υλικό των βακτηρίων επιπλέει ελεύθερα μέσα στο κύτταρο, καθιστώντας το ανοιχτό στη μεταφορά γονιδίων (τη μετακίνηση ενός τμήματος γενετικού υλικού από το ένα βακτηριακό κύτταρο στο άλλο), που συχνά περιλαμβάνει τη μετάδοση πλασμιδίων.

Στη φύση, οι πρωταρχικοί μηχανισμοί μεταφοράς βακτηριακών γονιδίων είναι η μεταγωγή και η σύζευξη. Η μεταγωγή συμβαίνει όταν ένας βακτηριακός ιός, που ονομάζεται βακτηριοφάγος, αποκολλάται από ένα βακτηριακό κύτταρο, μεταφέροντας μαζί του μέρος του γονιδιώματος αυτού του βακτηρίου και στη συνέχεια μολύνει ένα άλλο κύτταρο. Όταν ο βακτηριοφάγος εισάγει το γενετικό του περιεχόμενο στο γονιδίωμα του επόμενου βακτηρίου, το DNA του προηγούμενου βακτηρίου επίσης ενσωματώνεται στο γονιδίωμα. Η σύζευξη συμβαίνει όταν δύο βακτήρια έρχονται σε φυσική επαφή μεταξύ τους και ένα πλασμίδιο, που μερικές φορές φέρει ένα κομμάτι του χρωμοσωμικού DNA, μεταφέρεται από το κύτταρο δότη στο κύτταρο δέκτη. Τα πλασμίδια συχνά φέρουν γονίδια που κωδικοποιούν ένζυμα ικανά να αδρανοποιήσουν ορισμένα αντιβιοτικά. Η αρχική πηγή των γονιδίων για αυτά τα ένζυμα δεν είναι γνωστή με βεβαιότητα, ωστόσο, κινητά γενετικά στοιχεία, που ονομάζονται τρανσποζόνια (γονίδια «πηδώντας»), μπορεί να έπαιξαν ρόλο στην εμφάνισή τους και μπορεί να διευκολύνουν τη μεταφορά τους σε άλλα βακτηριακά είδη. Επειδή πολλά από τα πλασμίδια που φέρουν γονίδια ανθεκτικά στα αντιβιοτικά μπορούν να μεταφερθούν μεταξύ διαφορετικών ειδών βακτηρίων, μπορεί να αναπτυχθεί γρήγορα ευρεία αντίσταση σε ένα συγκεκριμένο αντιβιοτικό.

Η μετάδοση πλασμιδίων κατά τη σύζευξη έχει συσχετιστεί με τη δημιουργία πολλών διαφορετικών τύπων ανθεκτικών στα αντιβιοτικά βακτηρίων. Για παράδειγμα, η σύζευξη που περιλαμβάνει ένα πλασμίδιο που φέρει το γονίδιο για αντοχή στη μεθικιλλίνη (ένα αντιβιοτικό που προέρχεται από την πενικιλλίνη) υποπτεύεται ότι είχε ως αποτέλεσμα τη δημιουργία MRSA. Η πενικιλλίνη και η μεθικιλλίνη δρουν αποδυναμώνοντας το τοίχωμα του βακτηριακού κυττάρου όταν το τοίχωμα είναι σε κίνδυνο, η οσμωτική βαθμίδα μεταξύ του κυτταροπλάσματος ενός βακτηριακού κυττάρου και του περιβάλλοντός του αναγκάζει το κύτταρο να λύσει (άνοιγμα). Στο MRSA το γονίδιο που αποκτάται μέσω σύζευξης κωδικοποιεί μια πρωτεΐνη ικανή να αναστέλλει τη δέσμευση μεθικιλλίνης, εμποδίζοντας το φάρμακο να προσκολληθεί και να διαταράξει την πρωτεΐνη στόχο του στο βακτηριακό κυτταρικό τοίχωμα. Ένα άλλο παράδειγμα είναι ένα πλασμίδιο που φέρει ένα γονίδιο που κωδικοποιεί το ένζυμο βήτα-λακταμάση. Η βήτα-λακταμάση μεταβάλλει τη δομή του μορίου της πενικιλίνης, καθιστώντας το ανενεργό.

Η μεταγωγή και η σύζευξη καταλήγουν σε μια διαδικασία που ονομάζεται ανασυνδυασμός. Τα νέα βακτηριακά γονιδιώματα που παράγονται από γενετικό ανασυνδυασμό ονομάζονται ανασυνδυασμένα. Τα αντιβιοτικά δεν δημιουργούν ανασυνδυαστές - οι ανθεκτικοί στα αντιβιοτικά ανασυνδυαστές υπάρχουν φυσικά μέσω φυσιολογικών γεγονότων μεταφοράς γονιδίων.Ωστόσο, τα αντιβιοτικά, και ιδιαίτερα η ακατάλληλη χρήση αυτών των φαρμάκων, παρέχουν επιλεκτική πίεση στις βακτηριακές αποικίες, με αποτέλεσμα οι πιο ευαίσθητοι οργανισμοί να θανατώνονται γρήγορα και οι πιο ανθεκτικοί οργανισμοί μπορούν να επιβιώσουν και να αναπαραχθούν.


Αντοχή στα αντιβιοτικά

Η ανθεκτικότητα στα αντιβιοτικά είναι η ικανότητα ενός μικροοργανισμού να αντέχει τις επιδράσεις ενός αντιβιοτικού.

Είναι ένας συγκεκριμένος τύπος αντοχής στα φάρμακα.

Η αντοχή στα αντιβιοτικά εξελίσσεται φυσικά μέσω της φυσικής επιλογής μέσω τυχαίας μετάλλαξης, αλλά θα μπορούσε επίσης να κατασκευαστεί με την εφαρμογή ενός εξελικτικού στρες σε έναν πληθυσμό.

Μόλις δημιουργηθεί ένα τέτοιο γονίδιο, τα βακτήρια μπορούν στη συνέχεια να μεταφέρουν τη γενετική πληροφορία με οριζόντιο τρόπο (μεταξύ ατόμων) με ανταλλαγή πλασμιδίων.

Εάν ένα βακτήριο φέρει πολλά γονίδια ανθεκτικότητας, ονομάζεται πολυανθεκτικό ή, ανεπίσημα, υπερβακτηρίδιο.

Αιτίες Η αντοχή στα αντιβιοτικά μπορεί επίσης να εισαχθεί τεχνητά σε έναν μικροοργανισμό μέσω πρωτοκόλλων μετασχηματισμού.

Αυτός μπορεί να είναι ένας χρήσιμος τρόπος εμφύτευσης τεχνητών γονιδίων στον μικροοργανισμό.

Η αντοχή στα αντιβιοτικά είναι συνέπεια της εξέλιξης μέσω της φυσικής επιλογής.

Η αντιβιοτική δράση είναι μια περιβαλλοντική πίεση εκείνα τα βακτήρια που έχουν μια μετάλλαξη που τους επιτρέπει να επιβιώσουν θα συνεχίσουν να αναπαράγονται.

Στη συνέχεια θα περάσουν αυτό το χαρακτηριστικό στους απογόνους τους, οι οποίοι θα είναι μια πλήρως ανθεκτική γενιά.

Αρκετές μελέτες έχουν δείξει ότι τα πρότυπα χρήσης αντιβιοτικών επηρεάζουν σε μεγάλο βαθμό τον αριθμό των ανθεκτικών οργανισμών που αναπτύσσονται.

Η υπερβολική χρήση αντιβιοτικών ευρέος φάσματος, όπως οι κεφαλοσπορίνες δεύτερης και τρίτης γενιάς, επιταχύνει σημαντικά την ανάπτυξη αντοχής στη μεθικιλλίνη.

Άλλοι παράγοντες που συμβάλλουν στην αντίσταση περιλαμβάνουν λανθασμένη διάγνωση, περιττές συνταγές, ακατάλληλη χρήση αντιβιοτικών από τους ασθενείς και χρήση αντιβιοτικών ως πρόσθετων τροφίμων για τα ζώα για την προώθηση της ανάπτυξης.

Οι ερευνητές απέδειξαν πρόσφατα ότι η βακτηριακή πρωτεΐνη LexA μπορεί να παίζει βασικό ρόλο στην απόκτηση βακτηριακών μεταλλάξεων.

Ανθεκτικά παθογόνα Ο Staphylococcus aureus (κοινώς γνωστός ως "Staph aureus" ή Staph λοίμωξη) είναι ένα από τα κύρια ανθεκτικά παθογόνα.

Βρίσκεται στους βλεννογόνους και στο δέρμα περίπου του ενός τρίτου του πληθυσμού, είναι εξαιρετικά προσαρμόσιμο στην πίεση των αντιβιοτικών.

Ήταν το πρώτο βακτήριο στο οποίο βρέθηκε αντίσταση στην πενικιλίνη&mdashin το 1947, μόλις τέσσερα χρόνια μετά την έναρξη μαζικής παραγωγής του φαρμάκου.

Η μεθικιλλίνη ήταν τότε το αντιβιοτικό εκλογής, αλλά έκτοτε έχει αντικατασταθεί από οξακιλλίνη λόγω σημαντικής τοξικότητας στα νεφρά.

Ο MRSA (ανθεκτικός στη μεθικιλλίνη Staphylococcus aureus) εντοπίστηκε για πρώτη φορά στη Βρετανία το 1961 και τώρα είναι «αρκετά κοινός» στα νοσοκομεία.

Το MRSA ήταν υπεύθυνο για το 37% των θανατηφόρων περιπτώσεων δηλητηρίασης αίματος στο Ηνωμένο Βασίλειο το 1999, από 4% το 1991.

Οι μισές λοιμώξεις από S. aureus στις ΗΠΑ είναι ανθεκτικές στην πενικιλλίνη, τη μεθικιλλίνη, την τετρακυκλίνη και την ερυθρομυκίνη.

Αυτό άφησε τη βανκομυκίνη ως τον μόνο αποτελεσματικό παράγοντα που ήταν διαθέσιμος εκείνη την εποχή.

Ωστόσο, στελέχη με ενδιάμεσα (4-8 ug/ml) επίπεδα ανθεκτικότητας, που ονομάζονται GISA (γλυκοπεπτιδικό ενδιάμεσο Staphylococcus aureus) ή VISA (βανκομυκίνη ενδιάμεσο Staphylococcus aureus), άρχισαν να εμφανίζονται στα τέλη της δεκαετίας του 1990.

Το πρώτο κρούσμα εντοπίστηκε στην Ιαπωνία το 1996 και από τότε έχουν βρεθεί στελέχη σε νοσοκομεία στην Αγγλία, τη Γαλλία και τις ΗΠΑ.

Το πρώτο τεκμηριωμένο στέλεχος με πλήρη (>16ug/ml) ανθεκτικότητα στη βανκομυκίνη, που ονομάζεται VRSA (Vancomycin-resistant Staphylococcus aureus) εμφανίστηκε στις Ηνωμένες Πολιτείες το 2002.

Μια νέα κατηγορία αντιβιοτικών, οι οξαζολιδινόνες, έγινε διαθέσιμη τη δεκαετία του 1990 και η πρώτη εμπορικά διαθέσιμη οξαζολιδινόνη, η λινεζολίδη, είναι συγκρίσιμη με τη βανκομυκίνη σε αποτελεσματικότητα έναντι του MRSA.

Ανθεκτικότητα στη λινεζολίδη στον Staphylococcus aureus αναφέρθηκε το 2003.

Το CA-MRSA (κοινοτικό MRSA) έχει πλέον εμφανιστεί ως επιδημία που ευθύνεται για ταχέως εξελισσόμενες, θανατηφόρες ασθένειες, όπως η νεκρωτική πνευμονία, η σοβαρή σήψη και η νεκρωτική απονευρωσίτιδα.

Ο ανθεκτικός στη μεθικιλλίνη Staphylococcus aureus (MRSA) είναι το πιο συχνά αναγνωρισμένο παθογόνο ανθεκτικό στα αντιμικροβιακά φάρμακα στα νοσοκομεία των ΗΠΑ.

Η επιδημιολογία των λοιμώξεων που προκαλούνται από το MRSA αλλάζει ταχέως.

Τα τελευταία 10 χρόνια, λοιμώξεις που προκαλούνται από αυτόν τον οργανισμό έχουν εμφανιστεί στην κοινότητα.

Οι 2 κλώνοι MRSA στις Ηνωμένες Πολιτείες που συνδέονται στενότερα με εστίες της κοινότητας, οι USA400 (στέλεχος MW2, γενεαλογία ST1) και USA300, συχνά περιέχουν γονίδια Panton-Valentine λευκοσιδίνη (PVL) και, πιο συχνά, έχουν συσχετιστεί με λοιμώξεις του δέρματος και των μαλακών μορίων .

Έχουν αναφερθεί κρούσματα λοιμώξεων που σχετίζονται με την κοινότητα (CA)-MRSA σε σωφρονιστικές εγκαταστάσεις, σε αθλητικές ομάδες, σε νεοσύλλεκτους, σε παιδικούς σταθμούς νεογνών και σε ενεργούς ομοφυλόφιλους άνδρες.

Οι λοιμώξεις από CA-MRSA φαίνεται τώρα να είναι ενδημικές σε πολλές αστικές περιοχές και προκαλούν τα περισσότερα CA-S. λοιμώξεις του aureus.

Ο Enterococcus faecium είναι άλλο ένα υπερμικρόβιο που βρίσκεται στα νοσοκομεία.

Ο ανθεκτικός στην πενικιλλίνη εντερόκοκκος εμφανίστηκε το 1983, ο ανθεκτικός στη βανκομυκίνη εντερόκοκκος (VRE) το 1987 και ο ανθεκτικός στη λινεζολίδη εντερόκοκκος (LRE) στα τέλη της δεκαετίας του 1990.

Οι λοιμώξεις από Streptococcus pyogenes (Streptococcus Ομάδας Α: GAS) μπορούν συνήθως να αντιμετωπιστούν με πολλά διαφορετικά αντιβιοτικά.

Η έγκαιρη θεραπεία μπορεί να μειώσει τον κίνδυνο θανάτου από διηθητική στρεπτοκοκκική νόσο της ομάδας Α.

Ωστόσο, ακόμη και η καλύτερη ιατρική φροντίδα δεν αποτρέπει τον θάνατο σε κάθε περίπτωση.

Για όσους πάσχουν από πολύ σοβαρή ασθένεια, μπορεί να χρειαστεί υποστηρικτική φροντίδα σε μονάδα εντατικής θεραπείας.

Για άτομα με νεκρωτική απονευρωσίτιδα, συχνά απαιτείται χειρουργική επέμβαση για την αφαίρεση κατεστραμμένου ιστού.

Έχουν εμφανιστεί στελέχη S. pyogenes ανθεκτικά στα αντιβιοτικά μακρολιδίων, ωστόσο όλα τα στελέχη παραμένουν ομοιόμορφα ευαίσθητα στην πενικιλίνη.

Η αντοχή του Streptococcus pneumoniae στην πενικιλλίνη και σε άλλες βήτα-λακτάμες αυξάνεται παγκοσμίως.

Ο κύριος μηχανισμός αντίστασης περιλαμβάνει την εισαγωγή μεταλλάξεων σε γονίδια που κωδικοποιούν πρωτεΐνες που δεσμεύουν την πενικιλλίνη.

Η επιλεκτική πίεση θεωρείται ότι παίζει σημαντικό ρόλο και η χρήση αντιβιοτικών βήτα-λακτάμης έχει ενοχοποιηθεί ως παράγοντας κινδύνου για μόλυνση και αποικισμό.

Ο Streptococcus pneumoniae είναι υπεύθυνος για πνευμονία, βακτηριαιμία, μέση ωτίτιδα, μηνιγγίτιδα, ιγμορίτιδα, περιτονίτιδα και αρθρίτιδα.


Έλεγχος Αντίστασης στα Αντιβιοτικά

Μελέτες Ανάπτυξης Αντίστασης στα Αντιβιοτικά στα βακτήρια μπορεί να αξιολογηθεί με μελέτες αντοχής ενός ή πολλαπλών σταδίων. Οι μελέτες αντοχής ενός σταδίου περιλαμβάνουν το σχηματισμό ανθεκτικών μεταλλαγμάτων σε μία έκθεση στον αντιμικροβιακό παράγοντα, ενώ οι μελέτες αντοχής πολλαπλών σταδίων περιλαμβάνουν την έκθεση των βακτηρίων στον αντιμικροβιακό παράγοντα σε πολλές διόδους (υποκαλλιέργειες), επιτρέποντας το σχηματισμό μεταλλάξεων ανθεκτικότητας με την πάροδο του χρόνου. Τα αποτελέσματα από μελέτες αντοχής μπορούν να βοηθήσουν στην πρόβλεψη της συχνότητας των ανθεκτικών μεταλλαγμάτων που εμφανίζονται μετά την έκθεση σε έναν αντιμικροβιακό παράγοντα, καθώς και των τύπων ανθεκτικών στελεχών που μπορεί να αναπτυχθούν ή να εμφανιστούν στην κλινική.

Μελέτες αντίστασης σε ένα βήμα:

Συχνότητα αυθόρμητης μετάλλαξης: Αυτή η ανάλυση μπορεί να προσδιορίσει τη συχνότητα με την οποία εμφανίζονται μεταλλάγματα όταν εκτίθενται σε ανασταλτικές συγκεντρώσεις ενός αντιμικροβιακού παράγοντα (βλ. εικόνα παρακάτω).

Χαρακτηρισμός μεταλλάξεων: Οι σταθεροί μεταλλάκτες που απομονώθηκαν από τις μελέτες συχνότητας αυθόρμητων μεταλλάξεων χαρακτηρίζονται από μια δοκιμασία αραίωσης ζωμού MIC (σύμφωνα με τις οδηγίες CLSI) για την αντοχή τους στα αντιβιοτικά στον αντιμικροβιακό παράγοντα στον οποίο επιλέχθηκαν. Αυτό μπορεί να επιβεβαιώσει ότι οι μεταλλάκτες είναι ανθεκτικοί μεταλλάκτες, και επίσης μπορεί να καθορίσει το επίπεδο αντοχής στον αντιμικροβιακό παράγοντα. Περαιτέρω γενετικός χαρακτηρισμός αυτών των μεταλλαγμάτων μπορεί να βοηθήσει στην καλύτερη κατανόηση του μηχανισμού αντίστασης των βακτηρίων στον αντιμικροβιακό παράγοντα.

Συγκέντρωση πρόληψης μεταλλάξεων (MPC): Αυτή η ανάλυση μπορεί να προσδιορίσει τη συγκέντρωση του αντιμικροβιακού παράγοντα που εμποδίζει το βακτηριακό στέλεχος να σχηματίσει ανθεκτικές αποικίες. Το MPC είναι το χαμηλότερο in vitro συγκέντρωση αντιμικροβιακού παράγοντα στην οποία δεν ανακτώνται ανθεκτικά μεταλλάγματα.

Συχνότητα αυθόρμητης μετάλλαξης. Αυτό το σχήμα απεικονίζει τη γενική ροή εργασίας για τη διεξαγωγή μιας μονοβάθμιας, αυθόρμητης ανάλυσης συχνότητας μετάλλαξης. (1) Παρασκευάζεται υγρό άγαρ που περιέχει γνωστή συγκέντρωση αντιβιοτικών (συνήθως 4 φορές ή 8 φορές την τιμή MIC των βακτηρίων που εξετάζονται), χύνεται σε τρυβλία Petri και αφήνεται να στερεοποιηθεί. (2) Παρασκευάζεται μια γονική καλλιέργεια βακτηρίων και προσδιορίζεται η βακτηριακή πυκνότητα σε CFU/mL. (3) Η γονική καλλιέργεια βακτηρίων απλώνεται στην πλάκα άγαρ που περιέχει αντιβιοτικό και επωάζεται για έως και 3 ημέρες. (4) Ο αριθμός των CFU που ανακτήθηκαν απαριθμείται και αυτή η τιμή συγκρίνεται με τη γονική βακτηριακή πυκνότητα για τη δημιουργία συχνότητας μετάλλαξης.

Μελέτες αντίστασης πολλαπλών βημάτων:

Σειριακό πέρασμα: Αυτή η δοκιμασία αναπτύσσει ανθεκτικότητα στα βακτήρια με συνεχή διέλευση βακτηρίων που αναπτύσσονται σε υπο-MIC (υπο-ανασταλτικές) συγκεντρώσεις αντιμικροβιακού παράγοντα.

Σειριακό πέρασμα. Απεικόνιση της σειριακής ανάλυσης περάσματος. Μια μητρική καλλιέργεια παρασκευάζεται και χρησιμοποιείται για τον εμβολιασμό μιας σειράς αραιωμένης σειράς αντιμικροβιακής ένωσης. Η καλλιέργεια επωάζεται και την ημέρα 1 η συγκέντρωση MIC προσδιορίζεται ως η χαμηλότερη συγκέντρωση στην οποία δεν παρατηρείται ανάπτυξη. Η καλλιέργεια συγκέντρωσης υπο-MIC χρησιμοποιείται για τον εμβολιασμό μιας δεύτερης διαδοχικά αραιωμένης σειράς αντιμικροβιακής ένωσης και επωάζεται όλη τη νύχτα. Την επόμενη μέρα προσδιορίζεται το MIC (το οποίο μπορεί να παραμείνει το ίδιο ή να αυξηθεί) και η καλλιέργεια συγκέντρωσης υπο-MIC από το τελευταίο απόσπασμα χρησιμοποιείται για τον εμβολιασμό μιας νέας σειράς αραιωμένης αντιμικροβιακής ένωσης. Η διαδικασία συνεχίζεται για έως και 21 ημέρες ή έως ότου επιτευχθεί μια προκαθορισμένη συγκέντρωση τελικού σημείου.

Αντιμικροβιακούς Παράγοντες και Χημειοθεραπεία, Απρ. 2006, σελ. 1228–1237 Vol. 50, Νο. 4, Mani et al, Ιη vitro Χαρακτηρισμός του Αντιβακτηριακού Φάσματος των Νέων Βακτηριακών Αναστολέων Τοποϊσομεράσης Τύπου II της Κατηγορίας Αμινοβενζιμιδαζολών.


Υπάρχουν μερικοί σημαντικοί λόγοι που οδήγησαν σε αυτή την «αντιβιοτική αποκάλυψη». Ένας σημαντικός λόγος είναι ότι πολλοί από εμάς καταναλώνουμε υπερβολικά αντιβιοτικά [3], ακόμη και ως θεραπεία «μίας λήψης» για τη θεραπεία ενός κοινού κρυολογήματος μέσα σε 2 έως 3 ημέρες. Το ίδιο ισχύει και για τους γιατρούς που συνταγογραφούν υπερβολικά αντιβιοτικά. Έχω ακούσει τόσες πολλές ιστορίες από τη μητέρα μου, που είναι γιατρός, που ορισμένοι γιατροί συνταγογραφούν ισχυρά αντιβιοτικά ακόμη και σε ασθενείς με ήπιες λοιμώξεις, ώστε οι λοιμώξεις να θεραπευτούν μέσα σε λίγες μέρες. Η φήμη των γιατρών εξαπλώνεται και οι ασθενείς θα συνεχίσουν να τους συμβουλεύονται λόγω της λεγόμενης «αποτελεσματικής» θεραπείας που οδηγεί σε ταχεία ανάρρωση.

Από την άλλη πλευρά, η νοοτροπία των ασθενών έχει επίσης σημασία. Θα πρέπει να δώσετε στο σώμα σας αρκετή ξεκούραση, χρόνο και δύναμη (τρώγοντας καθαρά και υγιεινά) για να καταπολεμήσετε τη μόλυνση και να θεραπεύσετε φυσικά. Τα αντιβιοτικά θα πρέπει να είναι η έσχατη λύση εάν το ανοσοποιητικό σας σύστημα δεν είναι σε θέση να χειριστεί τη μόλυνση. Εάν ένας γιατρός δεν συνταγογραφήσει κανένα αντιβιοτικό ή τα αντιβιοτικά χρειάζονται χρόνο για να ανταποκριθούν, τότε οι ασθενείς θα σκεφτούν ότι δεν τους παίρνουν στα σοβαρά και θα απαιτήσουν αντιβιοτικά. Αυτές είναι πολύ θλιβερές καταστάσεις, καθώς υπάρχει μεγάλη πιθανότητα αυτά τα κοινά βακτηριακά στελέχη να προσαρμοστούν σε αυτά τα ισχυρά αντιβιοτικά (παρόλο που το ανοσοποιητικό σύστημα του σώματος μπορεί να διαχειριστεί τη μόλυνση ή ένα ήπιο αντιβιοτικό αρκεί για να τη σκοτώσει) και να αποκτήσουν αντίσταση στα αντιβιοτικά δεδομένου του χρόνου .

Εάν χρησιμοποιούμε αντιβιοτικά όταν δεν είναι απαραίτητα, μπορεί κάλλιστα να μην τα έχουμε όταν τα χρειαζόμαστε περισσότερο.

-Ο Δρ. Τομ Φρίντεν

Ένας άλλος βασικός λόγος για την ανάπτυξη ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά είναι η υπερβολική χρήση αντιβιοτικών στην κτηνοτροφία [3]. Οι ανθυγιεινές περιοχές όπου τα ζώα κρατούνται σε μεγάλους αριθμούς μπορούν να δημιουργήσουν ένα τέλειο έδαφος αναπαραγωγής για μικρόβια και ασθένειες. Ως εκ τούτου, σε πολλά ζώα χορηγούνται αντιβιοτικά για να μην αρρωστήσουν. Επιπλέον, στα ζώα χορηγούνται αντιβιοτικά για την προώθηση της ανάπτυξής τους επίσης. Δυστυχώς, αυτό έχει δημιουργήσει περισσότερα βακτήρια που είναι ανθεκτικά στα αντιβιοτικά με την πάροδο του χρόνου και είναι πιθανό να εισέλθουν στην τροφική μας αλυσίδα, ακόμη και χωρίς να το καταλάβουμε.


Το έργο των συγγραφέων' χρηματοδοτήθηκε από επιχορηγήσεις από την Ευρωπαϊκή Ένωση (PAR-241476 και EvoTAR-282004), το Instituto de Salud Carlos III – Υπουργείο Οικονομίας και Ανταγωνιστικότητας της Ισπανίας (FIS-PS09-02381 FIS-PI108-0 , PI12-01581), και την Περιφερειακή Κυβέρνηση της Μαδρίτης στην Ισπανία (PROMPT- S2010/BMD2414). Οι συγγραφείς είναι επίσης ευγνώμονες στο Ισπανικό Δίκτυο για τη Μελέτη Πλασμιδίων και Εξωχρωμοσωμικών Στοιχείων (REDEEX) για την ενθάρρυνση και τη χρηματοδότηση της συνεργασίας μεταξύ Ισπανών μικροβιολόγων που εργάζονται στη βιολογία των κινητών γενετικών στοιχείων (grant BFU 2012-0079-E/BMC Ισπανικό Υπουργείο Επιστημών και καινοτομία).

Aguilພ, R., Claessen, D., and Lambert, A. (2009). Καθήλωση αλληλόμορφων σε έναν δυναμικό μεταπληθυσμό: εφέ ιδρυτή έναντι εφέ καταφυγίου. Θεωρ. Popul. Biol. 76, 105�.

Aguilພ, R., Lambert, A., and Claessen, D. (2011). Οικολογική ειδοποίηση σε δυναμικά τοπία. J. Evol. Biol. 24, 2663�.

Allen, Η. Κ., Looft, Τ., Bayles, D. O., Humphrey, S., Levine, U. Y., Alt, D., et al. (2011). Τα αντιβιοτικά στις ζωοτροφές προκαλούν προφάγους στα μικροβιώματα των κοπράνων των χοίρων. MBio 2, e00260�.

Allen, H. K., Moe, L. A., Rodbumrer, J., Gaarder, A., and Handelsman, J. (2009). Η λειτουργική μεταγονιδιωματική αποκαλύπτει διάφορες β-λακταμάσες σε ένα απομακρυσμένο έδαφος της Αλάσκας. ISME J. 3, 243�.

Allison, S. D., and Martiny, J. B. H. (2008). Έγγραφο Colloquium: αντίσταση, ανθεκτικότητα και πλεονασμός σε μικροβιακές κοινότητες. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 105, 11512�.

Alonso, H., and Gready, J. E. (2006). Αναγωγάση διυδροφολικής δεσμευμένης με ιντεγόνη: ένα ένζυμο που αναδιατάχθηκε πρόσφατα. Trends Microbiol. 14, 236�.

Alvarez-Ortega, C., Wiegand, I., Olivares, J., Hancock, R. E. W., and Martínez, J. L. (2011). Η εγγενής αντίσταση του Pseudomonas aeruginosa σε β-λακτάμες. Τοξικότητα 2, 144�.

Aminov, R. I. (2009). Ο ρόλος των αντιβιοτικών και η αντίσταση στα αντιβιοτικά στη φύση. Περιβάλλω. Microbiol. 11, 2970�.

Aminov, R. I., and Mackie, R. I. (2007). Εξέλιξη και οικολογία γονιδίων ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά. FEMS Microbiol. Κάτοικος της Λατβίας. 271, 147�.

Andrade, L. N., Curiao, Τ., Ferreira, J. C., Longo, J. M., Clímaco, E. C., Martinez, R., et al. (2011). Διάδοση των μπλαKPC-2 από την εξάπλωση του Klebsiella pneumoniae κλωνικό σύμπλεγμα 258 κλώνοι (ST258, ST11, ST437) και πλασμίδια (IncFII, IncN, IncL/M) μεταξύ των ειδών Enterobacteriaceae στη Βραζιλία. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 55, 3579�.

Antonopoulos, D. A., Huse, S. M., Morrison, H. G., Schmidt, T. M., Sogin, M. L., and Young, V. B. (2009). Αναπαραγώγιμη δυναμική κοινότητας της γαστρεντερικής μικροχλωρίδας μετά από αντιβιοτική διαταραχή. Μολύνω. Immun. 77, 2367�.

Arumugam, Μ., Raes, J., Pelletier, Ε., Le Paslier, D., Yamada, Τ., Mende, D. R., et αϊ. (2011). Εντεροτύποι του μικροβιώματος του ανθρώπινου εντέρου. Φύση 473, 174�.

Aubert, D., Naas, T., Héritier, C., Poirel, L., and Nordmann, P. (2006). Λειτουργικός χαρακτηρισμός του IS1999, ενός στοιχείου της οικογένειας IS4 που εμπλέκεται στην κινητοποίηση και έκφραση των γονιδίων αντίστασης στη β-λακτάμη. J. Bacteriol. 188, 6506�.

Aziz, R. K., Breitbart, M., and Edwards, R. A. (2010). Οι τρανσποζάσες είναι τα πιο άφθονα, πιο πανταχού παρόντα γονίδια στη φύση. Nucleic Acids Res. 38, 4207�.

Baharoglu, Z., and Mazel, D. (2011). Vibrio cholerae πυροδοτεί SOS και μεταλλαξιογένεση ως απόκριση σε ένα ευρύ φάσμα αντιβιοτικών: μια οδός προς την πολυανθεκτικότητα. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 55, 2438�.

Bailey, J. K., Pinyon, J. L., Anantham, S., and Hall, R. M. (2011). Κατανομή του γονιδίου blaTEM και των τρανσποζονίων που περιέχουν blaTEM σε κοινή Escherichia coli. J. Antimicrob. Chemother. 66, 745�.

Balbus, J. M., Boxall, A. B. A., Fenske, R. A., McKone, T. E., and Zeise, L. (2013). Επιπτώσεις της παγκόσμιας κλιματικής αλλαγής για την αξιολόγηση και τη διαχείριση των κινδύνων για την ανθρώπινη υγεία από χημικές ουσίες στο φυσικό περιβάλλον. Περιβάλλω. Toxicol. Chem. 32, 62�.

Balloux, F. (2010). 𠇍δημογραφικές επιρροές στη δομή του πληθυσμού των βακτηρίων,” in Γενετική Βακτηριακού Πληθυσμού σε Λοιμώδη Νόσους, εκδ. D. A. Robinson, D. Falush, and E. J. Feil (Hoboken: John Wiley & Sons, Inc.), 103�.

Bapteste, E., Lopez, P., Bouchard, F., Baquero, F., McInerney, J. O., and Burian, R. M. (2012). Εξελικτικές αναλύσεις των μη γενεαλογικών δεσμών που παράγονται από την εισαγωγική καταγωγή. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 109, 18266�.

Baquero, F. (2009). Περιβαλλοντικό στρες και εξελικτικότητα σε μικροβιακά συστήματα. Clin. Microbiol. Μολύνω. 15, 5�.

Baquero, F. (2004). Από κομμάτια σε μοτίβα: εξελικτική μηχανική σε βακτηριακά παθογόνα. Nat. Rev. Microbiol. 2, 510�.

Baquero, F. (2012). Σχετικά με τη μεταβαλλόμενη ισορροπία: η περίπτωση του Η ασθένεια του σταφυλοκοκου CC398. MBio 3, e00078�.

Baquero, F. (2011). Η διάλεξη Garrod 2010: οι διαστάσεις της εξέλιξης στην αντοχή στα αντιβιοτικά: ex unibus plurum et ex pluribus unum. J. Antimicrob. Chemother. 66, 1659�.

Baquero, F., and Coque, T. M. (2011). Πολυεπίπεδη γενετική πληθυσμού στην αντοχή στα αντιβιοτικά. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 35, 705�.

Baquero, F., Coque, T. M., and de la Cruz, F. (2011). Οικολογία και εξέλιξη ως στόχοι: η ανάγκη για νέα eco-evo φάρμακα και στρατηγικές για την καταπολέμηση της αντοχής στα αντιβιοτικά. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 55, 3649�.

Baquero, F., Martínez, J.-L., and Cantón, R. (2008). Αντιβιοτικά και αντοχή στα αντιβιοτικά σε υδάτινα περιβάλλοντα. Curr. Γνώμη. Biotechnol. 19, 260�.

Baquero, F., and Negri, Μ. C. (1997). Επιλεκτικά διαμερίσματα για ανθεκτικούς μικροοργανισμούς σε βαθμίδες αντιβιοτικών. Βιοδοκιμές 19, 731�.

Baquero, F., and Nombela, C. (2012). Το μικροβίωμα ως ανθρώπινο όργανο. Clin. Microbiol. Μολύνω. 18, 2𠄴.

Baquero, M.-R., Galán, J. C., Del Carmen Turrientes, M., Cantón, R., Coque, T. M., Martínez, J. L., et al. (2005). Αυξημένες συχνότητες μεταλλάξεων σε Escherichia coli απομονώσεις που φιλοξενούν βήτα-λακταμάσες εκτεταμένου φάσματος. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 49, 4754�.

Barlow, M., and Hall, B. G. (2002). Προέλευση και εξέλιξη των AmpC β-λακταμάσες του Citrobacter freundii. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 46, 1190�. .

Becker, J., Eisenhauer, N., Scheu, S., and Jousset, A. (2012). Οι αυξανόμενες ανταγωνιστικές αλληλεπιδράσεις προκαλούν την κατάρρευση των βακτηριακών κοινοτήτων σε υψηλή ποικιλομορφία. Ecol. Κάτοικος της Λατβίας. 15, 468�.

Benveniste, R., and Davies, J. (1973). Ένζυμα αδρανοποίησης αντιβιοτικών αμινογλυκοσιδίων σε ακτινομύκητες παρόμοια με εκείνα που υπάρχουν σε κλινικές απομονώσεις βακτηρίων ανθεκτικών στα αντιβιοτικά. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 70, 2276�.

Bertels, F., and Rainey, P. B. (2011). Εξέλιξη εντός του γονιδιώματος των REPINs: μια νέα οικογένεια μικροσκοπικού κινητού DNA σε βακτήρια. PLoS Genet. 7: e1002132. doi: 10.1371/journal.pgen.1002132

Biel, S. W., and Hartl, D. L. (1983). Εξέλιξη τρανσποζονίων: φυσική επιλογή για Tn5 in Escherichia coli Κ12. Γενεσιολογία 103, 581�.

Biermann, F., Abbott, Κ., Andresen, S., B์kstrand, Κ., Bernstein, S., Betsill, Μ. Μ., et αϊ. (2012). Επιστήμη και κυβέρνηση. Πλοήγηση στο ανθρωπόκαινο: βελτίωση της διακυβέρνησης του συστήματος της Γης. Επιστήμη 335, 1306�.

Bisercić, Μ., and Ochman, Η. (1993). Φυσικοί πληθυσμοί των Escherichia coli και Salmonella typhimurium φιλοξενούν τις ίδιες κατηγορίες ακολουθιών εισαγωγής. Γενεσιολογία 133, 449�.

Blázquez, J., Couce, A., Rodríguez-Beltrán, J., and Rodríguez-Rojas, A. (2012). Τα αντιμικροβιακά ως υποκινητές γενετικής παραλλαγής. Curr. Γνώμη. Microbiol. 15, 561�.

Blot, Μ., Hauer, Β., and Monnet, G. (1994). Το γονίδιο αντίστασης της βλεομυκίνης Tn5 προσφέρει βελτιωμένο πλεονέκτημα επιβίωσης και ανάπτυξης Escherichia coli. ΜοΙ. στρατηγός Ζενέ. 242, 595�.

Bouma, J. Ε., and Lenski, R. Ε. (1988). Εξέλιξη σύνδεσης βακτηρίων/πλασμιδίου. Φύση 335, 351�.

Boyd, Ε. F., Hill, C. W., Rich, S. Μ., and Hartl, D. L. (1996). Μωσαϊκή δομή πλασμιδίων από φυσικούς πληθυσμούς του Escherichia coli. Γενεσιολογία 143, 1091�.

Boyd, E. S., and Barkay, T. (2012). Το οπερόνιο αντίστασης στον υδράργυρο: από μια προέλευση σε ένα γεωθερμικό περιβάλλον σε ένα αποτελεσματικό μηχάνημα αποτοξίνωσης. Εμπρός. Microbiol. 3:349. doi: 10.3389/fmicb.2012.00349

Brandon, R. (1987). Τα επίπεδα επιλογής: μια ιεραρχία αλληλεπιδρώντων,” in Ο ρόλος της συμπεριφοράς στην εξέλιξη, εκδ. H. Plotkin (Cambridge: MIT Press), 124�.

Brisse, S., Fevre, C., Passet, V., Issenhuth-Jeanjean, S., Tournebize, R., Diancourt, L., et al. (2009). Μολυσματικοί κλώνοι του Klebsiella pneumoniae: αναγνώριση και εξελικτικό σενάριο βασισμένο σε γονιδιωματικό και φαινοτυπικό χαρακτηρισμό. PloS ONE 4: e4982. doi: 10.1371/journal.pone.0004982

Cain, A. K., Liu, X., Djordjevic, S. P., and Hall, R. M. (2010). Τρανσποζόνια που σχετίζονται με Tn1696 σε πλασμίδια IncHI2 σε πολλαπλά ανθεκτικά στα αντιβιοτικά Salmonella enterica serovar Typhimurium από ζώα της Αυστραλίας. Microb. Αντίσταση στα ναρκωτικά. 16, 197�.

Cantón, R., and Coque, T. M. (2006). Η πανδημία της βήτα-λακταμάσης CTX-M. Curr. Γνώμη. Microbiol. 9, 466�.

Cantón, R., Mir, N., Sánchez, Μ., and Baquero, F. (1999). Κατανομή MIC και επίδραση εμβολιασμού του LY333328: μελέτη ευαίσθητων στη βανκομυκίνη και εντερόκοκκων τύπου VanA και VanC που ελήφθησαν από καλλιέργειες παρακολούθησης ασθενών της μονάδας εντατικής θεραπείας. Clin. Microbiol. Μολύνω. 5, 554�.

Carattoli, A. (2009). Οικογένειες πλασμιδίων ανθεκτικότητας στα Enterobacteriaceae. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 53, 2227�. .

Castillo, A., Eguiarte, L. E., and Souza, V. (2005). Μια γενετική ανάλυση γονιδιωματικού πληθυσμού της νήσου εξάλειψης των παθογόνων εντεροκυττάρων στο Escherichia coli: η αναζήτηση της μονάδας επιλογής. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 102, 1542�.

Chambers, H. F., and Deleo, F. R. (2009). Κύματα αντίστασης: Η ασθένεια του σταφυλοκοκου στην εποχή των αντιβιοτικών. Nat. Rev. Microbiol. 7, 629�.

Chao, L., and Levin, B. R. (1981). Δομημένα ενδιαιτήματα και η εξέλιξη των αντιανταγωνιστικών τοξινών στα βακτήρια. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 78, 6324�.

Claesson, M. J., Cusack, S., O'Sullivan, Ο., Greene-Diniz, R., De Weerd, Η., Flannery, Ε., et al. (2011). Σύνθεση, μεταβλητότητα και χρονική σταθερότητα της εντερικής μικροχλωρίδας των ηλικιωμένων. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ 108, 4586�.

Claesson, M. J., Jeffery, I. B., Conde, S., Power, S. E., Oɼonnor, E. M., Cusack, S., et al. (2012). Η σύνθεση της μικροχλωρίδας του εντέρου συσχετίζεται με τη διατροφή και την υγεία των ηλικιωμένων. Φύση 488, 178�.

Clewell, D. B., Weaver, K. E., Dunny, G. M., Coque, T. M., Francia, M. V., and Hayes, F. (2013). 𠇎Εξωχρωμοσωμικά και κινητά στοιχεία,” σε Εντεροκόκκοι. Μετάδοση, Συντήρηση και Επιδημιολογία, εκδ. M. S. Gilmore (υπό έκδοση).

Cohen, O., Ashkenazy, H., Burstein, D., and Pupko, T. (2012). Αποκάλυψη του συν-εξελικτικού δικτύου μεταξύ προκαρυωτικών γονιδίων. Βιοπληροφορική 28, i389–i394.

Comeau, A. M., Tétart, F., Trojet, S. N., Prère, M.-F., and Krisch, H. M. (2007). Συνέργεια Φάγου-Αντιβιοτικών (PAS): Τα αντιβιοτικά βήτα-λακτάμης και κινολόνης διεγείρουν τη λοιμογόνο ανάπτυξη των φάγων. PloS ONE 2:e799. doi: 10.1371/journal.pone.0000799

Coombs, J. M. (2009). Δυνατότητα οριζόντιας μεταφοράς γονιδίων σε μικροβιακές κοινότητες της γήινης επιφάνειας. Μέθοδοι ΜοΙ. Biol. 532, 413�.

Coque, T. M., Baquero, F., and Canton, R. (2008). Αυξανόμενος επιπολασμός των Εντεροβακτηριδίων που παράγουν ESBL στην Ευρώπη. Euro Surveill. 13, 19044.

Cordero, Ο. Χ., Wildschutte, Η., Kirkup, Β., Proehl, S., Ngo, L., Hussain, F., et αϊ. (2012). Οι οικολογικοί πληθυσμοί βακτηρίων λειτουργούν ως κοινωνικά συνεκτικές μονάδες παραγωγής και αντοχής στα αντιβιοτικά. Επιστήμη 337, 1228�.

Couce, A., and Blázquez, J. (2009). Παρενέργειες των αντιβιοτικών στη γενετική μεταβλητότητα. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 33, 531�.

Craig, N. L. (2002). “Tn7,” in Κινητό DNA II, εκδ. N. Craig, R. Craigie, M. Gellet, and A. M. Lambowitz (Washington: ASM Press), 432�.

Czekalski, N., Berthold, T., Caucci, S., Egli, A., and Bürgmann, Η. (2012). Αυξημένα επίπεδα πολυανθεκτικών βακτηρίων και γονιδίων ανθεκτικότητας μετά την επεξεργασία λυμάτων και τη διάδοσή τους στη λίμνη της Γενεύης, Ελβετία. Εμπρός. Microbiol. 3:106. doi: 10.3389/fmicb.2012.00106

Czárán, T. L., Hoekstra, R. F., and Pagie, L. (2002). Ο χημικός πόλεμος μεταξύ μικροβίων προάγει τη βιοποικιλότητα. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 99, 786�.

Dantas, G., Sommer, M. O. A., Oluwasegun, R. D., and Church, G. M. (2008). Βακτήρια που επιβιώνουν με αντιβιοτικά. Επιστήμη 320, 100�.

Datta, Ν., and Hughes, V. Μ. (1983). Πλασμίδια των ίδιων ομάδων Inc στα Enterobacteria πριν και μετά την ιατρική χρήση αντιβιοτικών. Φύση 306, 616�.

Davies, J. (2006). Είναι τα αντιβιοτικά φυσικά αντιβιοτικά; J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 33, 496�.

Day, M. D., Beck, D., and Foster, J. A. (2011). Οι μικροβιακές κοινότητες ως πειραματικές μονάδες. Βιοεπιστήμη 61, 398�.

Dɼosta, V. M., King, C. E., Kalan, L., Morar, M., Sung, W. W. L., Schwarz, C., et al. (2011). Η αντοχή στα αντιβιοτικά είναι αρχαία. Φύση 477, 457�.

De Gelder, L., Ponciano, J. M., Joyce, P., and Top, E. M. (2007). Σταθερότητα ενός ακατάστατου πλασμιδίου σε διαφορετικούς ξενιστές: καμία εγγύηση για μακροχρόνια σχέση. Μικροβιολογία 153, 452�.

del Pilar Garcillán-Barcia, M., Bernales, I., Mendiola, M. V., and De la Cruz, F. (2001). Μονόκλωνα ενδιάμεσα DNA σε μεταφορά κυλιόμενου κύκλου IS91. ΜοΙ. Microbiol. 39, 494�.

Del Solar, G., Alonso, J. C., Espinosa, Μ., and D໚z-Orejas, R. (1996). Αντιγραφή πλασμιδίου ευρέος εύρους ξενιστή: μια ανοιχτή ερώτηση. ΜοΙ. Microbiol. 21, 661�.

de Regt, Μ. J. Α., Van Schaik, W., Van Luit-Asbroek, Μ., Dekker, Η. Α. Τ., Van Duijkeren, Ε., Koning, C. J. Μ., et al. (2012). Νοσοκομειακή και κοινότητα ανθεκτική στην αμπικιλλίνη Enterococcus faecium είναι εξελικτικά στενά συνδεδεμένα αλλά έχουν διαφοροποιηθεί μέσω της εξειδικευμένης προσαρμογής. PloS ONE 7: e30319. doi: 10.1371/journal.pone.0030319

Dethlefsen, L., Eckburg, P. B., Bik, E. M., and Relman, D. A. (2006). Συναρμολόγηση της ανθρώπινης εντερικής μικροχλωρίδας. Τάσεις Οικ. Evol. 21, 517�.

Dionisio, F., Conceição, I. C., Marques, A. C. R., Fernandes, L., and Gordo, I. (2005). Η εξέλιξη ενός συζευκτικού πλασμιδίου και η ικανότητά του να αυξάνει την ικανότητα των βακτηρίων. Biol. Κάτοικος της Λατβίας. 1, 250�.

Domingues, S., Harms, K., Fricke, W. F., Johnsen, P. J., Da Silva, G. J., and Nielsen, K. M. (2012). Ο φυσικός μετασχηματισμός διευκολύνει τη μεταφορά τρανσποζονίων, ιντεγκρονίων και γονιδιακών κασετών μεταξύ βακτηριακών ειδών. PLoS Pathog. 8:e1002837. doi: 10.1371/journal.ppat.1002837

Doolittle, W. F., and Zhaxybayeva, O. (2010). Μεταγονιδιωματική και μονάδες βιολογικής οργάνωσης. BioScience 60, 102�.

Doyle, M., Fookes, M., Ivens, A., Mangan, M. W., Wain, J., and Dorman, C. J. (2007). Μια κρυφή πρωτεΐνη τύπου H-NS βοηθά στην οριζόντια μετάδοση του DNA στα βακτήρια. Επιστήμη 315, 251�.

Dupré, J., and O'Malley, M. A. (2007). Μεταγονιδιωματική και βιολογική οντολογία. Κουμπί κολάρου. Ιστορ. Philos. Biol. Biomed. Sci. 38, 834�.

Fajardo, A., and Martínez, J. L. (2008). Τα αντιβιοτικά ως σήματα που πυροδοτούν συγκεκριμένες βακτηριακές αποκρίσεις. Curr. Γνώμη. Microbiol. 11, 161�.

Fajardo, Α., Martínez-Martín, Ν., Mercadillo, Μ., Galán, J. C., Ghysels, Β., Matthijs, S., et al. (2008). Η παραμελημένη εγγενής αντίσταση των βακτηριακών παθογόνων. PloS ONE 3:e1619. doi: 10.1371/journal.pone.0001619

Faust, K., and Raes, J. (2012). Μικροβιακές αλληλεπιδράσεις: από τα δίκτυα στα μοντέλα. Nat. Rev. Microbiol. 10, 538�.

Faust, Κ., Sathirapongsasuti, J. F., Izard, J., Segata, Ν., Gevers, D., Raes, J., et αϊ. (2012). Σχέσεις μικροβιακής συν-εμφάνισης στο ανθρώπινο μικροβίωμα. PLoS Comput. Biol. 8: e1002606. doi: 10.1371/journal.pcbi.1002606

Fernández-Alarcón, C., Singer, R. S., and Johnson, T. J. (2011). Συγκριτική γονιδιωματική πλασμιδίων IncA/C που κωδικοποιούν αντοχή σε πολλαπλά φάρμακα από κοινά και παθογόνα Escherichia coli από πολλές ζωικές πηγές. PloS One 6:e23415. doi: 10.1371/journal.pone.0023415

Fondi, M., and Fani, R. (2010). Η οριζόντια ροή της αντίστασης του πλασμιδίου: ενδείξεις από δίκτυα ομοιότητας μεταξύ γενεών. Περιβάλλω. Microbiol. 12: 3228�.

Forsberg, K. J., Reyes, A., Wang, B., Selleck, E. M., Sommer, M. O. A., and Dantas, G. (2012). Η κοινή αντιβιοτική αντίσταση των βακτηρίων του εδάφους και των ανθρώπινων παθογόνων. Επιστήμη 337, 1107�.

Fouhy, F., Guinane, C. Μ., Hussey, S., Wall, R., Ryan, C. Α., Dempsey, Ε. Μ., et al. (2012). Η αλληλουχία υψηλής απόδοσης αποκαλύπτει την ατελή, βραχυπρόθεσμη ανάκτηση της μικροχλωρίδας του εντέρου του βρέφους μετά από παρεντερική αντιβιοτική θεραπεία με αμπικιλλίνη και γενταμυκίνη. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 56, 5811�.

Francino, M. P. (2012). Η οικολογία των βακτηριακών γονιδίων και η επιβίωση του νέου. Int. J. Evol. Biol. 2012, 394026.

Freilich, S., Kreimer, A., Meilijson, I., Gophna, U., Sharan, R., and Ruppin, E. (2010). Η μεγάλης κλίμακας οργάνωση του βακτηριακού δικτύου αλληλεπιδράσεων οικολογικής συν-εμφάνισης. Nucleic Acids Res. 38, 3857�.

Freitas, A. R., Novais, C., Tedim, A. P., Francia, M. V., Baquero, F., and Coque, T. M. (2013). Μικροεξελικτικά γεγονότα που περιλαμβάνουν στενό πλασμίδιο ξενιστή επηρεάζουν την τοπική σταθεροποίηση της αντίστασης στη βανκομυκίνη σε Εντεροκόκκος. PloS ONE (υπό έκδοση).

Garcillán-Barcia, M. P., Alvarado, A., and De la Cruz, F. (2011). Ταυτοποίηση βακτηριακών πλασμιδίων με βάση την κινητικότητα και τη βιολογία του πληθυσμού των πλασμιδίων. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 35, 936�.

Garcillán-Barcia, M. P., Francia, M. V., and De la Cruz, F. (2009). Η ποικιλομορφία των συζευκτικών χαλαρασών και η εφαρμογή τους στην ταξινόμηση των πλασμιδίων. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 33, 657�.

Garcillán-Barcia, M. P., and de la Cruz, F. (2002). Κατανομή αλληλουχιών εισαγωγής οικογένειας IS91 σε βακτηριακά γονιδιώματα: εξελικτικές επιπτώσεις. FEMS Microbiol. Ecol. 42, 303�.

Garc໚-Quintanilla, M., and Casadesús, J. (2011). Μολυσματική ανταλλαγή πλασμιδίων μεταξύ των στελεχών ATCC 14028, LT2 και SL1344 του Salmonella enterica οροπαραγωγός Typhimurium. Πλασμίδιο 65, 169�.

Gaze, W. H., Abdouslam, N., Hawkey, P. M., and Wellington, E. M. H. (2005). Επίπτωση ολοκληρωμάτων κατηγορίας 1 σε περιβάλλον μολυσμένο από ένωση τεταρτοταγούς αμμωνίου. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 49, 1802�.

Gaze, W. Η., Zhang, L., Abdouslam, Ν. Α., Hawkey, Ρ. Μ., Calvo-Bado, L., Royle, J., et αϊ. (2011). Επιπτώσεις της ανθρωπογενούς δραστηριότητας στην οικολογία των ολοκληρωμάτων κατηγορίας 1 και των γονιδίων που σχετίζονται με το ιντεγόνη στο περιβάλλον. ISME J. 5, 1253�.

Ghosh, A., Dowd, S. E., and Zurek, L. (2011). Οι σκύλοι που φεύγουν από τη ΜΕΘ φέρουν έναν πολύ μεγάλο ανθεκτικό σε πολλαπλά φάρμακα εντεροκοκκικό πληθυσμό με ικανότητα σχηματισμού βιοφίλμ και οριζόντια μεταφορά γονιδίων. PloS ONE 6:e22451. doi: 10.1371/journal.pone.0022451

Gillings, M. R., and Stokes, H. W. (2012). Αυξάνουν οι άνθρωποι την εξελικτικότητα των βακτηρίων; Τάσεις Οικ. Evol. 27, 346�.

Gilliver, Μ. Α., Bennett, Μ., Begon, Μ., Hazel, S. Μ., and Hart, C. Α. (1999). Αντοχή στα αντιβιοτικά που εντοπίζεται σε άγρια ​​τρωκτικά. Φύση 401, 233�.

Goffin, C., and Ghuysen, J. Μ. (1998). Πολυμορφικές πρωτεΐνες που δεσμεύουν την πενικιλλίνη: μια αινιγματική οικογένεια ορθολόγων και παραλόγων. Microbiol. ΜοΙ. Biol. Στροφή μηχανής. 62, 1079�.

Goh, E.-B., Yim, G., Tsui, W., McClure, J., Surette, M. G., and Davies, J. (2002). Μεταγραφική τροποποίηση της βακτηριακής γονιδιακής έκφρασης με υποανασταλτικές συγκεντρώσεις αντιβιοτικών. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 99, 17025�.

Graessler, J., Qin, Υ., Zhong, Η., Zhang, J., Licinio, J., Wong, Μ.-L., et αϊ. (2012). Μεταγονιδιωματική αλληλουχία του μικροβιώματος του ανθρώπινου εντέρου πριν και μετά τη βαριατρική χειρουργική επέμβαση σε παχύσαρκους ασθενείς με διαβήτη τύπου 2: συσχέτιση με φλεγμονώδεις και μεταβολικές παραμέτρους. Pharmacogenomics J. doi: 10.1038/tpj.2012.43 [Epub πριν από την εκτύπωση].

Graidy, N. G. (2002). “Η κίνηση των στοιχείων που μοιάζουν με Tn3. Transposase και συνολοκλήρωση ανάλυσης,” in Κινητό DNA II, εκδ. N. L. Craig, R. Craigie, M. Gellet, and A. M. Lambowitz (Washington: ASM Press), 272�.

Guerin, Ε., Cambray, G., Sanchez-Alberola, Ν., Campoy, S., Erill, Ι., Da Re, S., et αϊ. (2009). Η απόκριση SOS ελέγχει τον ανασυνδυασμό ολοκληρώνων. Επιστήμη 324, 1034.

Guglielmini, J., De la Cruz, F., and Rocha, E. P. C. (2013). Εξέλιξη συστημάτων σύζευξης και έκκρισης τύπου IV. ΜοΙ. Biol. Evol. 30, 315�.

Guglielmini, J., Quintais, L., Garcillán-Barcia, M. P., De la Cruz, F., and Rocha, E. P. C. (2011). Το ρεπερτόριο του ICE σε προκαρυώτες υπογραμμίζει την ενότητα, την ποικιλομορφία και την πανταχού παρουσία της σύζευξης. PLoS Genet. 7:e1002222. doi: 10.1371/journal.pgen.1002222

Gullberg, Ε., Cao, S., Berg, O. G., Ilb์k, C., Sandegren, L., Hughes, D., et al. (2011). Επιλογή ανθεκτικών βακτηρίων σε πολύ χαμηλές συγκεντρώσεις αντιβιοτικών. PLoS Pathog. 7: e1002158. doi:10.1371/journal.ppat.1002158

Halary, S., Leigh, J. W., Cheaib, B., Lopez, P., and Bapteste, E. (2010). Το δίκτυο αναλύει τη δομή της γενετικής ποικιλότητας σε ανεξάρτητους γενετικούς κόσμους. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 107, 127�.

Hallatschek, O. (2012). Τα βακτήρια εξελίσσονται για να πάνε ενάντια στους κόκκους. Η φυσικη 5, 93.

Halling-Sørensen, B., Nors Nielsen, S., Lanzky, P. F., Ingerslev, F., Holten Lützhྏt, H. C., and Jørgensen, S. E. (1998). Εμφάνιση, τύχη και επιπτώσεις φαρμακευτικών ουσιών στο περιβάλλον𠄺 επισκόπηση. Χημειόσφαιρα 36, 357�.

Hamprecht, A., Poirel, L., Göttig, S., Seifert, H., Kaase, M., and Nordmann, P. (2012). Ανίχνευση της καρβαπενεμάσης GIM-1 σε Enterobacter cloacae Στα γερμανικά. J. Antimicrob. Chemother. doi: 10.1093/jac/dks447 [Epub πριν από την εκτύπωση].

Hartl, D. L., Dykhuizen, D. E., Miller, R. D., Green, L., and De Framond, J. (1983). Μεταθέσιμο στοιχείο IS50 βελτιώνει τον ρυθμό ανάπτυξης του Ε. coli κύτταρα χωρίς μεταφορά. Κύτταρο 35, 503�.

Henderson-Begg, S. K., Livermore, D. M., and Hall, L. M. C. (2006). Επίδραση υποανασταλτικών συγκεντρώσεων αντιβιοτικών στη συχνότητα μετάλλαξης στο Streptococcus pneumoniae. J. Antimicrob. Chemother. 57, 849�.

Hermsen, R., Deris, J. B., and Hwa, T. (2012). Σχετικά με την ταχύτητα της εξέλιξης της αντοχής στα αντιβιοτικά που διευκολύνεται από μια βαθμίδα συγκέντρωσης. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 109, 10775�.

Heuer, Η., Binh, C. Τ. Τ., Jechalke, S., Kopmann, C., Zimmerling, U., Krögerrecklenfort, Ε., et al. (2012). Τα πλασμίδια IncP-1ε είναι σημαντικοί φορείς γονιδίων ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά σε γεωργικά συστήματα: η διαφοροποίηση καθοδηγείται από κασέτες γονιδίων ιντεγκρονίων κατηγορίας 1. Εμπρός. Microbiol. 3:2. doi: 10.3389/fmicb.2012.00002

Heuer, H., and Smalla, K. (2012). Τα πλασμίδια ενθαρρύνουν τη διαφοροποίηση και την προσαρμογή των βακτηριακών πληθυσμών στο έδαφος. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 36, 1083�.

Hickman, A. B., Chandler, M., and Dyda, F. (2010). Ενσωμάτωση προκαρυωτικών και ευκαρυωτικών: τρανσποζάσεις DNA υπό το φως της δομής. Κριτ. Rev. Biochem. ΜοΙ. Biol. 45, 50�.

Hidron, Α. Ι., Edwards, J. R., Patel, J., Horan, T. C., Sievert, D. Μ., Pollock, D. A., et al. (2008). Ετήσια ενημέρωση του NHSN: παθογόνα ανθεκτικά στα αντιμικροβιακά που σχετίζονται με λοιμώξεις που σχετίζονται με την υγειονομική περίθαλψη: ετήσια περίληψη δεδομένων που αναφέρονται στο Εθνικό Δίκτυο Ασφάλειας Υγείας στα Κέντρα Ελέγχου και Πρόληψης Νοσημάτων, 2006-2007. Μολύνω. Κέντρο Ελέγχου. Epidemiol. 29, 996�.

Hildebrandt, M. A., Hoffmann, C., Sherrill-Mix, S. A., Keilbaugh, S.Α., Hamady, Μ., Chen, Υ.-Υ., et αϊ. (2009). Η δίαιτα υψηλής περιεκτικότητας σε λιπαρά καθορίζει τη σύνθεση του μικροβιώματος του εντέρου του ποντικού ανεξάρτητα από την παχυσαρκία. Γαστρεντερολογία 137, 1716�.

Hocquet, D., Llanes, C., Thouverez, M., Kulasekara, H. D., Bertrand, X., Plésiat, Ρ., et al. (2012). Στοιχεία για πρόκληση αντοχής στα αντιβιοτικά με βάση το ιντεγκρόν από την απόκριση SOS σε κλινικό περιβάλλον. PLoS Pathog. 8: e1002778. doi: 10.1371/journal.ppat.1002778

Hughes, J. Μ., Lohman, Β. Κ., Deckert, G. E., Nichols, Ε. Ρ., Settles, Μ., Abdo, Ζ., et αϊ. (2012). Ο ρόλος της κλωνικής παρεμβολής στην εξελικτική δυναμική της προσαρμογής πλασμιδίου-ξενιστή. MBio 3, e00077�.

Hughes, V. Μ., and Datta, Ν. (1983). Συζευκτικά πλασμίδια σε βακτήρια της εποχής “προ-αντιβιοτικών”. Φύση 302, 725�.

Humphrey, Β., Thomson, N. R., Thomas, C. Μ., Brooks, Κ., Sanders, Μ., Delsol, Α. Α., et al. (2012). Fitness του Escherichia coli στελέχη που φέρουν εκφρασμένα και μερικώς σιωπηλά πλασμίδια IncN και IncP1. BMC Microbiol. 12:53. doi: 10.1186/1471-2180-12-53

Jeffery, I. B., Claesson, M. J., O'Toole, P. W., and Shanahan, F. (2012). Κατηγοριοποίηση της μικροχλωρίδας του εντέρου: εντεροτύποι ή βαθμίδες; Nat. Rev. Microbiol. 10, 591�.

Jones, B. V. (2010). Το κινητό μεταγονιδίωμα του ανθρώπινου εντέρου: μια προοπτική του μεταζωαρίου. Μικρόβια εντέρου 1, 415�.

Kholodii, G., Mindlin, S., Petrova, M., and Minakhina, S. (2003). Tn5060 από το μόνιμο πάγο της Σιβηρίας σχετίζεται στενότερα με τον πρόγονο του Tn21 πριν από την απόκτηση του integron. FEMS Microbiol. Κάτοικος της Λατβίας. 226, 251�.

Kohanski, M. A., DePristo, M. A., and Collins, J. J. (2010). Η υποθανατηφόρα αντιβιοτική αγωγή οδηγεί σε ανθεκτικότητα σε πολλά φάρμακα μέσω μεταλλαξογένεσης που προκαλείται από ρίζες. ΜοΙ. Κύτταρο 37, 311�.

Kondrashov, F. A., Rogozin, I. B., Wolf, Y. I., and Koonin, E. V. (2002). Επιλογή στην εξέλιξη των διπλασιασμών γονιδίων. Genome Biol. 3, research0008.1–research0008.9.

Ktari, S., Arlet, G., Mnif, Β., Gautier, V., Mahjoubi, F., Ben Jmeaa, Μ., et al. (2006). Εμφάνιση πολυανθεκτικών Klebsiella pneumoniae απομονώσεις που παράγουν VIM-4 μεταλλο-βήτα-λακταμάση, CTX-M-15 εκτεταμένου φάσματος βήτα-λακταμάση και CMY-4 AmpC βήτα-λακταμάση σε πανεπιστημιακό νοσοκομείο της Τυνησίας. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 50, 4198�.

Kylafis, G., and Loreau, M. (2011). Κατασκευή θέσεων υπό το πρίσμα της θεωρίας θέσεων. Ecol. Κάτοικος της Λατβίας. 14, 82�.

Labbate, M., Case, R. J., and Stokes, H. W. (2009). Το σύστημα κασέτας ιντεγκρονίου/γονιδίου: ένας ενεργός παίκτης στη βακτηριακή προσαρμογή. Μέθοδοι ΜοΙ. Biol. 532, 103�.

Laland, Κ. Ν., Odling-Smee, F. J., and Feldman, Μ. W. (1999). Εξελικτικές συνέπειες της κατασκευής θέσεων και οι επιπτώσεις τους στην οικολογία. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 96, 10242�.

Lang, K. S., Danzeisen, J. L., Xu, W., and Johnson, T. J. (2012). Χαρτογράφηση μεταγραφώματος του pAR060302, ενός blaCMY-2-θετικού ευρείας περιοχής ξενιστή IncA/C πλασμιδίου. Appl. Περιβάλλω. Microbiol. 78, 3379�.

Lawrence, J. G. (1997). Εγωιστικά οπερόνια και ειδογένεση με μεταφορά γονιδίων. Trends Microbiol. 5, 355�.

Levin, B. R. (2010). Άσχημοι ιοί, ακριβά πλασμίδια, δυναμική πληθυσμού και συνθήκες για τη δημιουργία και τη διατήρηση της προσαρμοστικής ανοσίας στα βακτήρια με τη μεσολάβηση CRISPR. PLoS Genet. 6: e1001171. doi: 10.1371/journal.pgen.1001171

Lewontin, R. C. (1970). Οι μονάδες επιλογής. Annu. Σεβ. Οικολ. Συστ. 1, 1�.

Ley, R. E., Turnbaugh, P. J., Klein, S., and Gordon, J. I. (2006). Μικροβιακή οικολογία: μικρόβια του ανθρώπινου εντέρου που σχετίζονται με την παχυσαρκία. Φύση 444, 1022�.

Li, J. V., Ashrafian, Η., Bueter, Μ., Kinross, J., Sands, C., Le Roux, C. W., et αϊ. (2011). Η μεταβολική χειρουργική επηρεάζει σε μεγάλο βαθμό τη διασταυρούμενη συνομιλία μικροβιακού εντέρου-μεταβολικού ξενιστή. Εντερο 60, 1214�.

Liebert, C. Α., Hall, R. Μ., and Summers, Α. Ο. (1999). Transposon Tn21, ναυαρχίδα του πλωτού γονιδιώματος. Microbiol. ΜοΙ. Biol. Στροφή μηχανής. 63, 507�.

Lim, J. Y., Yoon, J., and Hovde, C. J. (2010). Μια σύντομη επισκόπηση του Escherichia coli Ο157:Η7 και το πλασμίδιο του Ο157. J. Microbiol. Biotechnol. 20, 5�.

Linares, J. F., Gustafsson, I., Baquero, F., and Martinez, J. L. (2006). Τα αντιβιοτικά ως παράγοντες ενδομικροβιακής σηματοδότησης αντί για όπλα. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 103, 19484�.

Livermore, D. M. (2000). Αντοχή στα αντιβιοτικά στους σταφυλόκοκκους. Int. J. Antimicrob. Πράκτορες 16, S3–S10.

Lloyd, E. (2008). ȁΜονάδες και επίπεδα επιλογής,” in Η Εγκυκλοπαίδεια της Φιλοσοφίας του Στάνφορντ, εκδ. Ε. Ν. Ζάλτα.

Looft, T., and Allen, H. K. (2012). Παράπλευρες επιδράσεις των αντιβιοτικών στα μικροβιώματα του εντέρου των θηλαστικών. Μικρόβια εντέρου 3, 463�.

Looft, Τ., Johnson, Τ. Α., Allen, Η. Κ., Bayles, D. Ο., Alt, D. Ρ., Stedtfeld, R. D., et αϊ. (2012). Τα αντιβιοτικά της τροφής στο μικροβίωμα του εντέρου των χοίρων. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 109, 1691�.

Luo, C., Walk, S. T., Gordon, D. M., Feldgarden, M., Tiedje, J. M., and Konstantinidis, K. T. (2011). Αλληλουχία γονιδιώματος του περιβάλλοντος Escherichia coli διευρύνει την κατανόηση της οικολογίας και της ειδογένεσης του μοντέλου βακτηριακών ειδών. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 108, 7200�.

Lupo, A., Coyne, S., and Berendonk, T. U. (2012). Προέλευση και εξέλιξη της αντοχής στα αντιβιοτικά: οι κοινοί μηχανισμοί εμφάνισης και εξάπλωσης σε υδάτινα σώματα. Εμπρός. Microbiol. 3:18. doi: 10.3389/fmicb.2012.00018

Maiden, M. C. (1998). Οριζόντια γενετική ανταλλαγή, εξέλιξη και εξάπλωση της αντοχής στα αντιβιοτικά στα βακτήρια. Clin. Μολύνω. Dis. 27, S12–S20.

Marchesi, J. R. (2010). Προκαρυωτική και ευκαρυωτική ποικιλομορφία του ανθρώπινου εντέρου. Adv. Appl. Microbiol. 72, 43�.

Marchesi, J. R. (2011). Μετάβαση από μια γονοκεντρική σε μεταβολίτη-κεντρική στρατηγική για τον προσδιορισμό του μικροβιώματος του πυρήνα του εντέρου. Bioeng. Σφάλματα 2, 309�.

Marraffini, L. A., and Sontheimer, E. J. (2010). Παρεμβολή CRISPR: Προσαρμοστική ανοσία κατευθυνόμενη από RNA σε βακτήρια και αρχαία. Nat. Αιδ. Genet. 11, 181�.

Martinez, Ε., Marquez, C., Ingold, Α., Merlino, J., Djordjevic, S. P., Stokes, H. W., et al. (2012). Διαφορετικά κινητοποιημένα ολοκληρώματα κατηγορίας 1 είναι κοινά στα χρωμοσώματα των παθογόνων Pseudomonas aeruginosa κλινικές απομονώσεις. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 56, 2169�.

Martinez, J. L., Fajardo, Α., Garmendia, L., Hernandez, Α., Linares, J. F., Martínez-Solano, L., et al. (2009). Μια παγκόσμια άποψη της αντοχής στα αντιβιοτικά. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 33, 44�.

Martínez, J. L. (2008). Αντιβιοτικά και γονίδια ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά σε φυσικό περιβάλλον. Επιστήμη 321, 365�.

Martínez, J. L. (2011). Συμφόρηση στη δυνατότητα μεταφοράς της αντοχής στα αντιβιοτικά από τα φυσικά οικοσυστήματα σε ανθρώπινα βακτηριακά παθογόνα. Εμπρός. Microbiol. 2:265. doi: 10.3389/fmicb.2011.00265

Martínez, J. L., Baquero, F., and Andersson, D. I. (2007). Πρόβλεψη αντοχής στα αντιβιοτικά. Nat. Rev. Microbiol. 5, 958�.

Martínez, J. L., and Rojo, F. (2011). Μεταβολική ρύθμιση της αντοχής στα αντιβιοτικά. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 35, 768�.

Mayr, Ε. (1997). Τα αντικείμενα επιλογής. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 94, 2091�.

Mazel, D. (2006). Integrons: παράγοντες βακτηριακής εξέλιξης. Nat. Rev. Microbiol. 4, 608�.

McBride, S. M., Fischetti, V. A., Leblanc, D. J., Moellering, R. C., and Gilmore, M. S. (2007). Γενετική ποικιλότητα μεταξύ Enterococcus faecalis. PloS ONE 2:e582. doi: 10.1371/journal.pone.0000582

Merlin, C., Mahillon, J., Nesvera, J., and Touissant, Α. (2000). “Συντάκτες και μεταφορείς γονιδίων: η αρθρωτή δομή των βακτηριακών κινητών στοιχείων,” σε Η Οριζόντια Γονιδιακή Δεξαμενή. Βακτηριακά πλασμίδια και γονιδιακή εξάπλωση, εκδ. C. M. Thomas (Harwood Academic Press), 363�.

Mindlin, S., Minakhin, L., Petrova, M., Kholodii, G., Minakhina, S., Gorlenko, Z., et al. (2005). Τα σημερινά τρανσποζόνια αντίστασης στον υδράργυρο είναι κοινά σε βακτήρια που διατηρούνται σε μόνιμα παγωμένα εδάφη από το Ανώτερο Πλειστόκαινο. Res. Microbiol. 156, 994�.

Mindlin, S. Z., Soina, V. S., Petrova, M. A., and Gorlenko, Z. M. (2008). Απομόνωση βακτηριακών στελεχών ανθεκτικών στα αντιβιοτικά από ιζήματα μόνιμου παγετού της Ανατολικής Σιβηρίας. Ρας. J. Genet. 44, 27�.

Mizrahi, I. (2012). Το πλασμίδιο της κοιλίας: ένας κόμβος γενετικής επικοινωνίας για το μικροβίωμα της κοιλίας. Οχλος. Genet. Στοιχεία 2, 152�.

Monira, S., Nakamura, S., Gotoh, Κ., Izutsu, Κ., Watanabe, Η., Alam, Ν. Η., et αϊ. (2011). Εντερική μικροχλωρίδα υγιών και υποσιτισμένων παιδιών στο Μπαγκλαντές. Εμπρός. Microbiol. 2:228. doi: 10.3389/fmicb.2011.00228

Moura, A., Pereira, C., Henriques, I., and Correia, A. (2012). Νέες κασέτες γονιδίων και ολοκληρώματα σε ανθεκτικά στα αντιβιοτικά βακτήρια που απομονώνονται από αστικά λύματα. Res. Microbiol. 163, 92�.

Naas, T., Cuzon, G., Villegas, M.-V., Lartigue, M.-F., Quinn, J. P., and Nordmann, P. (2008). Γενετικές δομές στην αρχή απόκτησης του γονιδίου β-λακταμάσης bla KPC. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 52, 1257�.

Negri, M.-C., Lipsitch, M., Blazquez, J., Levin, B. R., and Baquero, F. (2000). Επιλογή μικρών φαινοτυπικών διαφορών που εξαρτώνται από τη συγκέντρωση στην αντίσταση στα αντιβιοτικά με τη μεσολάβηση της βήτα-λακταμάσης TEM. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 44, 2485�.

Nogueira, T., Rankin, D. J., Touchon, M., Taddei, F., Brown, S. P., and Rocha, E. P. C. (2009). Η οριζόντια γονιδιακή μεταφορά του εκκριτώματος οδηγεί την εξέλιξη της βακτηριακής συνεργασίας και λοιμογόνου δράσης. Curr. Biol. 19, 1683�.

Norberg, P., Bergström, M., Jethava, V., Dubhashi, D., and Hermansson, M. (2011). Η ραχοκοκαλιά του πλασμιδίου IncP-1 προσαρμόζεται σε διαφορετικά βακτηριακά είδη ξενιστή και εξελίσσεται μέσω ομόλογου ανασυνδυασμού. Nat. Commun. 2, 268.

Norman, A., Hansen, L. H., and Sørensen, S. J. (2009). Συζευκτικά πλασμίδια: αγγεία της κοινής δεξαμενής γονιδίων. Philos. Μεταφρ. R. Soc. Lond. Β ΒίοΙ. Sci. 364, 2275�.

Novais, A., Baquero, F., Machado, E., Cantón, R., Peixe, L., and Coque, T. M. (2010a). Η διεθνής εξάπλωση και η επιμονή του TEM-24 προκαλείται από τη συρροή κλώνων εντεροβακτηριδίων υψηλής διείσδυσης και ενός πλασμιδίου IncA/C2 που περιέχει Tn1696::Tn1 και IS5075-Tn21. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 54, 825�.

Novais, Α., Comas, Ι., Baquero, F., Cantón, R., Coque, Τ. Μ., Moya, Α., et al. (2010β). Εξελικτικές τροχιές των ενζύμων συστάδας βήτα-λακταμάσης CTX-M-1: πρόβλεψη αντοχής στα αντιβιοτικά. PLoS Pathog. 6:e1000735. doi: 10.1371/journal.ppat.1000735

Novais, Α., Pires, J., Ferreira, Η., Costa, L., Μαυροβούνιο, C., Vuotto, C., et al. (2012α). Χαρακτηρισμός της παγκόσμιας εξάπλωσης Escherichia coli Απομονώσεις ST131 (1991 έως 2010). Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 56, 3973�.

Novais, C., Freitas, A. R., Silveira, E., Baquero, F., Peixe, L., Roberts, Α. Ρ., et al. (2012β). Ένα υβρίδιο tet(S/M) από ανασυνδυασμό CTn6000 και CTn916. Μικροβιολογία 158, 2710�.

Novais, Α., Vuotto, C., Pires, J., Μαυροβούνιο, C., Donelli, G., Coque, Τ. Μ., et al. (2013). Ποικιλομορφία και ικανότητα παραγωγής βιοφίλμ μεταξύ των απομονώσεων επιδημικών κλωνικών ομάδων (ST69, ST393 και ST405) Escherichia coli φυλοομάδα Δ. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. (υπό έκδοση).

Näsvall, J., Sun, L., Roth, J. R., and Andersson, D. I. (2012). Εξέλιξη νέων γονιδίων σε πραγματικό χρόνο μέσω καινοτομίας, ενίσχυσης και απόκλισης. Επιστήμη 338, 384�.

Okasha, S. (2004). Πολυεπίπεδη επιλογή και καταμερισμός της συνδιακύμανσης: σύγκριση τριών προσεγγίσεων. Εξέλιξη 58, 486�.

Osterblad, Μ., Norrdahl, Κ., Korpimäki, Ε., and Huovinen, Ρ. (2001). Αντοχή στα αντιβιοτικά. Πόσο άγρια ​​είναι τα άγρια ​​θηλαστικά; Φύση 409, 37�.

Parks, A. R., Li, Z., Shi, Q., Owens, R. M., Jin, M. M., and Peters, J. E. (2009). Η μεταφορά σε αναδιπλασιαζόμενο DNA λαμβάνει χώρα μέσω της αλληλεπίδρασης με τον παράγοντα διεργασίας. Κύτταρο 138, 685�.

Parks, A. R., and Peters, J. E. (2009). Στοιχεία Tn7: δημιουργώντας ποικιλομορφία από χρωμοσώματα σε επισώματα. Πλασμίδιο 61, 1�.

Partridge, S. R. (2011). Ανάλυση περιοχών ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά σε Gram-αρνητικά βακτήρια. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 35, 820�.

Partridge, S. R., and Hall, R. M. (2004). Σύνθετη περιοχή πολλαπλών αντιβιοτικών και αντοχής στον υδράργυρο που προέρχεται από το r-det του NR1 (R100). Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 48, 4250�.

Partridge, S. R., and Hall, R. M. (2003). Το είναι1111 μέλη της οικογένειας IS4321 και είναι5075 έχουν υποτερματικές ανεστραμμένες επαναλήψεις και στοχεύουν τις τερματικές ανεστραμμένες επαναλήψεις του Tn21 οικογενειακά μεταθετά. J. Bacteriol. 185, 6371�.

Partridge, S. R., and Iredell, J. R. (2012). Γενετικά πλαίσια του blaNDM-1. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 56, 6065�.

Pedró, L., Baños, R. C., Aznar, S., Madrid, C., Balsalobre, C., and Juárez, A. (2011). Αντιβιοτικά που διαμορφώνουν το βακτηριακό γονιδίωμα: διαγραφή ενός καθοριστικού παράγοντα λοιμογόνου παράγοντα IS91 κατά την έκθεση σε υποανασταλτικές συγκεντρώσεις αντιβιοτικού. PloS ONE 6:e27606. doi: 10.1371/journal.pone.0027606

Perron, G. G., Gonzalez, A., and Buckling, A. (2007). Η δυναμική πηγή-νεροχύτη διαμορφώνει την εξέλιξη της αντοχής στα αντιβιοτικά και το πλειοτροπικό κόστος της φυσικής κατάστασης. Proc. Biol. Sci. 274, 2351�.

Petrova, M., Gorlenko, Z., and Mindlin, S. (2009). Μοριακή δομή και μετατόπιση μιας περιοχής πολλαπλής αντοχής στα αντιβιοτικά ενός στελέχους Psychrobacter psychrophilus permafrost. FEMS Microbiol. Κάτοικος της Λατβίας. 296, 190�.

Petrova, M., Gorlenko, Z., and Mindlin, S. (2011). Tn5045, ένα νέο τρανσποζόνιο με αντιβιοτικό και ανθεκτικό σε χρωμικό ιντεγόνη που απομονώθηκε από βακτήριο μόνιμου παγετού. Res. Microbiol. 162, 337�.

Poirel, L., Bonnin, R. A., and Nordmann, P. (2012). Γενετική υποστήριξη και ποικιλομορφία επίκτητων β-λακταμάσες εκτεταμένου φάσματος σε Gram-αρνητικές ράβδους. Μολύνω. Genet. Evol. 12, 883�.

Poirel, L., Rodríguez-Martínez, J.-M., Al Naiemi, N., Debets-Ossenkopp, Y. J., and Nordmann, P. (2010). Χαρακτηρισμός της DIM-1, μιας μεταλλο-βήτα-λακταμάσης κωδικοποιημένης με ιντεγόνη από Pseudomonas stutzeri κλινική απομόνωση στην Ολλανδία. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 54, 2420�.

Pomiankowski, Α. (1999). “ενδογονιδιωματική σύγκρουση,” in Επίπεδα Επιλογής στην Εξέλιξη, εκδ. L. Keller (Princeton University Press), 121�.

Popa, O., Hazkani-Covo, E., Landan, G., Martin, W., and Dagan, T. (2011). Τα κατευθυνόμενα δίκτυα αποκαλύπτουν γονιδιωματικούς φραγμούς και παρακάμψεις επιδιόρθωσης DNA στην πλευρική μεταφορά γονιδίων μεταξύ προκαρυωτών. Genome Res. 21, 599�.

Post, V., and Hall, R. M. (2009). Ακολουθίες εισαγωγής στο IS1111 οικογένεια που στοχεύει το attC θέσεις ανασυνδυασμού κασετών γονιδίων που σχετίζονται με το ιντεγκρόν. FEMS Microbiol. Κάτοικος της Λατβίας. 290, 182�.

Potron, A., Nordmann, P., Rondinaud, E., Jaureguy, F., and Poirel, L. (2013). Ένα μωσαϊκό τρανσποζόνιο που κωδικοποιεί το OXA-48 και το CTX-M-15: προς την παν-αντίσταση. J. Antimicrob. Chemother. 68, 476�.

Qu, Y., and Spain, J. C. (2011). Η καταβολική οδός για τη 2-νιτροϊμιδαζόλη περιλαμβάνει μια νέα νιτροϋδρολάση που επίσης προσδίδει αντοχή στο φάρμακο. Περιβάλλω. Microbiol. 13, 1010�.

Quinteira, S., Novais, C., Antunes, Ρ., Campos, J., Freitas, Α. R., Abdukadir, Α., et αϊ. (2011). Παρακολούθηση αντοχής στα αντιβιοτικά κατά μήκος του Δρόμου του Μεταξιού. Clin. Microbiol. Μολύνω. 17, s58–s59.

Rankin, D. J., Ginty, S. Ε. Μ., Nogueira, Τ., Touchon, Μ., Taddei, F., Rocha, Ε. Ρ. C., et αϊ. (2011a). Βακτηριακή συνεργασία που ελέγχεται από κινητά στοιχεία: η επιλογή συγγενών και η μολυσματικότητα αποτελούν μέρος της ίδιας διαδικασίας. Κληρονομικότητα 107, 279�.

Rankin, D. J., Rocha, E. P. C., and Brown, S. P. (2011b). Ποια χαρακτηριστικά μεταφέρονται σε κινητά γενετικά στοιχεία και γιατί; Κληρονομικότητα 106, 1�.

Rankin, D. J., Turner, L. A., Heinemann, J. A., and Brown, S. P. (2012). Η συνεξέλιξη γονιδίων τοξίνης και αντιτοξίνης οδηγεί τη δυναμική των βακτηριακών συμπλεγμάτων εθισμού και της ενδογονιδιωματικής σύγκρουσης. Proc. Biol. Sci. 279, 3706�.

Revilla, C., Garcillán-Barcia, M. P., Fernández-López, R., Thomson, N. R., Sanders, M., Cheung, M., et al. (2008). Διαφορετικές οδοί για την απόκτηση γονιδίων αντίστασης που απεικονίζονται από την πρόσφατη εξέλιξη των πλασμιδίων IncW. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 52, 1472�.

Rodriguez-Valera, F., and Ussery, D. W. (2012). Είναι και το παν-γονιδίωμα παν-σελεκτομή; F1000 Res. 1:16.

San Millán, A., Heilbron, K., and MacLean, R. C. (2012). Η θετική επίσταση μεταξύ των πλασμιδίων που μολύνουν ταυτόχρονα προάγει τη σταθερότητα του πλασμιδίου και τη διατήρηση της αντοχής σε πολλά φάρμακα. στο IPBC (Santander).

Santacruz, A., Collado, M. C., Garc໚-Valdés, L., Segura, M. T., Martín-Lagos, J. A., Anjos, T., et al. (2010). Η σύνθεση της μικροχλωρίδας του εντέρου σχετίζεται με το σωματικό βάρος, την αύξηση βάρους και τις βιοχημικές παραμέτρους σε εγκύους. Br J. Nutr. 104, 83�.

Schlüter, A., Szczepanowski, R., Pühler, A., and Top, E. M. (2007). Η γονιδιωματική των πλασμιδίων αντοχής στα αντιβιοτικά IncP-1 που απομονώνονται από μονάδες επεξεργασίας λυμάτων παρέχει στοιχεία για μια ευρέως προσβάσιμη γονιδιακή δεξαμενή ανθεκτικότητας στα φάρμακα. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 31, 449�.

Sen, D., Van der Auwera, G. A., Rogers, L. M., Thomas, C. M., Brown, C. J., and Top, E. M. (2011). Τα πλασμίδια ευρείας περιοχής ξενιστή από γεωργικά εδάφη έχουν ραχοκοκαλιά IncP-1 με διάφορα βοηθητικά γονίδια. Appl. Περιβάλλω. Microbiol. 77, 7975�.

Seputiene, V., Povilonis, J., and Suziedeliene, E. (2012). Νέες παραλλαγές νησιών αντίστασης AbaR με κοινή ραχοκοκαλιά Acinetobacter baumannii απομονώσεις του Ευρωπαϊκού κλώνου II. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 56, 1969�.

Shearer, J. E. S., Wireman, J., Hostetler, J., Forberger, Η., Borman, J., Gill, J., et αϊ. (2011). Μεγάλες οικογένειες πολυανθεκτικών πλασμιδίων από γεωγραφικά και επιδημιολογικά διαφορετικές σταφυλόκοκκους. G3 1, 581�.

Shi, P., Jia, S., Zhang, X.-X., Zhang, T., Cheng, S., and Li, A. (2013). Μεταγονιδιωματικές γνώσεις για τις επιδράσεις της χλωρίωσης στη μικροβιακή αντοχή στα αντιβιοτικά στο πόσιμο νερό. Water Res. 47, 111�.

Silva, R. F., Mendon๺, S. C. Μ., Carvalho, L. M., Reis, Α. Μ., Gordo, Ι., Trindade, S., et al. (2011). Διάχυτη επίσταση σημείων μεταξύ συζευκτικών πλασμιδίων και χρωμοσωμικών μεταλλάξεων ανθεκτικών στα φάρμακα. PLoS Genet. 7: e1002181. doi: 10.1371/journal.pgen.1002181

Sjölund, Μ., Bonnedahl, J., Hernandez, J., Bengtsson, S., Cederbrant, G., Pinhassi, J., et al. (2008). Διάδοση πολυανθεκτικών βακτηρίων στην Αρκτική. Emerg. Μολύνω. Dis. 14, 70�.

Skippington, E., and Ragan, M. A. (2011). Πλευρική γενετική μεταφορά και κατασκευή κοινοτήτων γενετικής ανταλλαγής. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 35, 707�.

Skippington, E., and Ragan, M. A. (2012). Η φυλογένεση και όχι η οικολογία ή ο τρόπος ζωής προκαταλαμβάνει την κατασκευή του Escherichia coli-Shigella κοινότητες γενετικής ανταλλαγής. Open Biol. 2, 120112.

Smillie, C. S., Smith, M. B., Friedman, J., Cordero, O. X., David, L. A., and Alm, E. J. (2011). Η οικολογία οδηγεί ένα παγκόσμιο δίκτυο ανταλλαγής γονιδίων που συνδέει το ανθρώπινο μικροβίωμα. Φύση 480, 241�.

Smith, J. (2012). Τραγωδία των κοινών μεταξύ πλασμιδίων αντοχής στα αντιβιοτικά. Εξέλιξη 66, 1269�.

Smorawinska, Μ., Szuplewska, Μ., Zaleski, Ρ., Wawrzyniak, Ρ., Maj, Α., Plucienniczak, Α., et al. (2012). Κινητοποιήσιμα πλασμίδια στενού εύρους ξενιστών ως φυσικοί φορείς αυτοκτονίας που επιτρέπουν την οριζόντια μεταφορά γονιδίων μεταξύ βακτηριακών ειδών που σχετίζονται με απόσταση. FEMS Microbiol. Κάτοικος της Λατβίας. 326, 76�.

Sobecky, P. A., and Hazen, T. H. (2009). Οριζόντια μεταφορά γονιδίων και κινητά γενετικά στοιχεία σε θαλάσσια συστήματα. Μέθοδοι ΜοΙ. Biol. 532, 435�.

Sommer, M. O. A., Dantas, G., and Church, G. M. (2009). Λειτουργικός χαρακτηρισμός της δεξαμενής ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά στην ανθρώπινη μικροχλωρίδα. Επιστήμη 325, 1128�.

Stalder, Τ., Barraud, Ο., Casellas, Μ., Dagot, C., and Ploy, M.-C. (2012). Συμμετοχή του Integron στην περιβαλλοντική εξάπλωση της αντοχής στα αντιβιοτικά. Εμπρός. Microbiol. 3:119. doi: 10.3389/fmicb.2012.00119

Stokes, H. W., and Gillings, M. R. (2011). Γονιδιακή ροή, κινητά γενετικά στοιχεία και στρατολόγηση γονιδίων ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά σε Gram-αρνητικά παθογόνα. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 35, 790�.

Stokes, H. W., Martinez, E., Roy Chowdhury, P., and Djordjevic, S. (2012). Κατηγορία 1 εξάπλωση των περιοχών αντίστασης που σχετίζεται με το ολοκλήρωμα Pseudomonas aeruginosa: πλασμιδικές ή χρωμοσωμικές πλατφόρμες; J. Antimicrob. Chemother. 67, 1799�.

Suzuki, H., Yano, H., Brown, C. J., and Top, E. M. (2010). Πρόβλεψη πλασμιδιακής ασυδοσίας με βάση τη γονιδιωματική υπογραφή. J. Bacteriol. 192, 6045�.

Sánchez, M. B., and Martínez, J. L. (2012). Διαφορική επιγενετική συμβατότητα των καθοριστικών παραγόντων αντοχής στα αντιβιοτικά qnr με το χρωμόσωμα του Escherichia coli. PloS ONE 7:e35149. doi: 10.1371/journal.pone.0035149

Tagliabue, A., and Elli, M. (2012). Ο ρόλος της μικροχλωρίδας του εντέρου στην ανθρώπινη παχυσαρκία: Πρόσφατα ευρήματα και μελλοντικές προοπτικές. Nutr. Metab. Καρδιοαγγειακή. Dis. (υπό έκδοση).

Tamames, J., Abellán, J. J., Pignatelli, M., Camacho, A., and Moya, A. (2010). Περιβαλλοντική κατανομή προκαρυωτικών κατηγοριών. BMC Microbiol. 10, 85. doi: 10.1186/1471-2180-10-85

Tamminen, M., Virta, M., Fani, R., and Fondi, M. (2012). Μεγάλης κλίμακας ανάλυση των σχέσεων πλασμιδίου μέσω δικτύων κοινής χρήσης γονιδίων. ΜοΙ. Biol. Evol. 29, 1225�.

Tato, M., Coque, T. M., Baquero, F., and Cantón, R. (2010). Διασπορά καρβαπενεμάσης μπλαVIM-1 γονίδιο που σχετίζεται με διαφορετικό Tn402 παραλλαγές, τρανσποζόνια υδραργύρου και συζευκτικά πλασμίδια σε εντεροβακτηρίδια και Pseudomonas aeruginosa. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 54, 320�.

Tetu, S. G., and Holmes, A. J. (2008). Μια οικογένεια αλληλουχιών εισαγωγής που επηρεάζει τα ολοκληρώματα με ειδική στόχευση θέσεων ανασυνδυασμού γονιδιακής κασέτας, το IS1111-attC Ομάδα. J. Bacteriol. 190, 4959�.

Toleman, M. A., Bennett, P. M., and Walsh, T. R. (2006). Στοιχεία ISCR: νέα συστήματα σύλληψης γονιδίων του 21ου αιώνα; Microbiol. ΜοΙ. Biol. Στροφή μηχανής. 70, 296�.

Toleman, M. A., and Walsh, T. R. (2011). Συνδυαστικά συμβάντα αλληλουχιών εισαγωγής και ICE σε Gram-αρνητικά βακτήρια. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 35, 912�.

Tolmasky, Μ. Ε. (1990). Αλληλουχία και έκφραση aadA, bla και tnpR από το πολυανθεκτικό τρανσποζόνιο Tn1331. Πλασμίδιο 24, 218�.

Ubeda, C., Maiques, E., Knecht, E., Lasa, I., Novick, R. P., and Penadés, J. R. (2005). Η επαγόμενη από αντιβιοτικά απόκριση SOS προάγει την οριζόντια διάδοση των παραγόντων λοιμογόνου δράσης που κωδικοποιούνται από νησίδες παθογένειας στους σταφυλόκοκκους. ΜοΙ. Microbiol. 56, 836�.

Vallès, Y., Gosalbes, M. J., De Vries, L. E., Abellán, J. J., and Francino, M. P. (2012). Μεταγονιδιωματική και ανάπτυξη της μικροχλωρίδας του εντέρου σε βρέφη. Clin. Microbiol. Μολύνω. 18, 21�.

Valverde, A., Cantón, R., Garcillán-Barcia, M. P., Novais, A., Galán, J. C., Alvarado, A., et al. (2009). Η εξάπλωση του bla (CTX-M-14) καθοδηγείται κυρίως από πλασμίδια IncK που διαχέονται μεταξύ Escherichia coli φυλοομάδες Α, Β1 και Δ στην Ισπανία. Αντιμικροβιακό. Agents Chemother. 53, 5204�.

Via, S. (2012). Οτοστόπ απόκλισης και εξάπλωση της γονιδιωματικής απομόνωσης κατά τη διάρκεια της οικολογικής ειδογένεσης-με-γονιδιακή-ροή. Philos. Μεταφρ. R. Soc. Lond. Β ΒίοΙ. Sci. 367, 451�.

Vishnivetskaya, T. A., and Kathariou, S. (2005). Υποτιθέμενες τρανσποζάσες που διατηρήθηκαν σε απομονώσεις Exiguobacterium από τον αρχαίο μόνιμο πάγο της Σιβηρίας και από σύγχρονους επιφανειακούς οικοτόπους. Appl. Περιβάλλω. Microbiol. 71, 6954�.

Waksman, S. A. (1961). “Ο ρόλος των αντιβιοτικών στη φύση,” σε Προοπτικές στη Βιολογία και την Ιατρική, Τομ. 4 (Chicago: University of Chicago Press), 271�.

Walsh, T. R. (2006). Συνδυαστική γενετική εξέλιξη της πολυανθεκτικότητας. Curr. Γνώμη. Microbiol. 9, 476�.

Werren, J. H. (2011). Εγωιστικά γενετικά στοιχεία, γενετική σύγκρουση και εξελικτική καινοτομία. Proc. Natl. Ακαδ. Sci. ΗΠΑ. 108, 10863�.

Wiedenbeck, J., and Cohan, F. M. (2011). Προέλευση της βακτηριακής ποικιλότητας μέσω οριζόντιας γενετικής μεταφοράς και προσαρμογής σε νέες οικολογικές θέσεις. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 35, 957�.

Willems, R. J. L., Hanage, W. P., Bessen, D. E., and Feil, E. J. (2011). Πληθυσμιακή βιολογία θετικών κατά Gram παθογόνων: κλώνοι υψηλού κινδύνου για τη διάδοση της αντοχής στα αντιβιοτικά. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 35, 872�.

Willems, R. J. L., Top, J., Van Schaik, W., Leavis, Η., Bonten, Μ., Sirén, J., et al. (2012). Περιορισμένη γονιδιακή ροή μεταξύ νοσοκομειακών υποπληθυσμών του Enterococcus faecium. MBio 3, e00151�.

Williams, L. E., Wireman, J., Hilliard, V. C., and Summers, A. O. (2012). Μεγάλα πλασμίδια του Escherichia coli και Σαλμονέλα κωδικοποιούν πολύ διαφορετικές σειρές βοηθητικών γονιδίων σε κοινές οικογένειες αντιγραφών. Πλασμίδιο 69, 36�.

Woodford, N., Turton, J. F., and Livermore, D. M. (2011). Πολυανθεκτικά Gram-αρνητικά βακτήρια: ο ρόλος των κλώνων υψηλού κινδύνου στη διάδοση της αντοχής στα αντιβιοτικά. FEMS Microbiol. Στροφή μηχανής. 35, 736�.

Wozniak, R. A. F., and Waldor, M. K. (2010). Ολοκληρωτικά και συζευκτικά στοιχεία: μωσαϊκά κινητά γενετικά στοιχεία που επιτρέπουν τη δυναμική πλευρική ροή γονιδίων. Nat. Rev. Microbiol. 8, 552�.

Wright, M. S., Baker-Austin, C., Lindell, A. H., Stepanauskas, R., Stokes, H. W., and McArthur, J. V. (2008). Επίδραση της βιομηχανικής μόλυνσης σε κινητά γενετικά στοιχεία: αφθονία ιντεγκρονίων κατηγορίας 1 και δομή γονιδιακής κασέτας σε υδρόβιες βακτηριακές κοινότητες. ISME J. 2, 417�.

Yim, G., Wang, H. H., and Davies, J. (2007). Τα αντιβιοτικά ως μόρια σηματοδότησης. Philos. Μεταφρ. R. Soc. Lond. Β. ΒίοΙ. Sci. 362, 1195�.

Yun, C.-S., Suzuki, C., Naito, Κ., Takeda, Τ., Takahashi, Υ., Sai, F., et αϊ. (2010). Το Pmr, μια πρωτεΐνη της οικογένειας πρωτεΐνης H1 (H-NS) που μοιάζει με ιστόνη που κωδικοποιείται από το πλασμίδιο IncP-7 pCAR1, είναι ένας βασικός παγκόσμιος ρυθμιστής που μεταβάλλει τη λειτουργία του ξενιστή. J. Bacteriol. 192, 4720�.

Zalasiewicz, J., Williams, M., Haywood, A., and Ellis, M. (2011). Το Ανθρωπόκαινο: μια νέα εποχή του γεωλογικού χρόνου; Philos. Διεξάγω. Ένα Μαθηματικό. Φυσ. Eng. Sci. 369, 835�.

Zhang, Q., Lambert, G., Liao, D., Kim, Η., Robin, Κ., Tung, C., et αϊ. (2011). Επιτάχυνση εμφάνισης βακτηριακής αντοχής στα αντιβιοτικά σε συνδεδεμένα μικροπεριβάλλοντα. Επιστήμη 333, 1764�.

Zheng, Y., Anton, B. P., Roberts, R. J., and Kasif, S. (2005). Φυλογενετική ανίχνευση συντηρημένων συστάδων γονιδίων σε μικροβιακά γονιδιώματα. BMC Bioinformatics 6:243. doi: 10.1186/1471-2105-6-243

Zheng, Y., Roberts, R. J., and Kasif, S. (2004). Τμηματικά μεταβλητά γονίδια: μια νέα προοπτική για την προσαρμογή. PLoS Biol. 2, Ε81. doi: 10.1371/journal.pbio.0020081

Zhong, X., Droesch, J., Fox, R., Top, E. M., and Krone, S. M. (2012). Σχετικά με τη σημασία και την εκτίμηση των ρυθμών μεταφοράς πλασμιδίου για βακτηριακούς πληθυσμούς που σχετίζονται με την επιφάνεια και καλά αναμεμειγμένους. J. Theor. Biol. 294, 144�.

Zhong, X., Krol, J. E., Top, E. M., and Krone, S. M. (2010). Λογιστική για το σχηματισμό ζευγαρώματος στη δυναμική του πληθυσμού των πλασμιδίων. J. Theor. Biol. 262, 711�.

Λέξεις κλειδιά : αντιβιοτικά, ανθεκτικότητα, βιολογία πληθυσμού, επιλογή πολλαπλών επιπέδων, εξέλιξη, εξελικτικότητα, αντίσταση, μικροβίωμα

Αναφορά: Baquero F, Tedim AP and Coque TM (2013) Η ανθεκτικότητα στα αντιβιοτικά που διαμορφώνει την πολυεπίπεδη πληθυσμιακή βιολογία των βακτηρίων. Εμπρός. Microbiol. 4:15. doi: 10.3389/fmicb.2013.00015

Λήψη: 14 Δεκεμβρίου 2012 Δημοσιεύτηκε έγγραφο σε εκκρεμότητα: 08 Ιανουαρίου 2013
Αποδοχή: 22 Ιανουαρίου 2013 Δημοσιεύθηκε διαδικτυακά: 06 Μαρτίου 2013.

Fiona Walsh, Agroscope Changins Wnswil, Ελβετία

Jose L. Martinez, Centro Nacional de Biotecnolog໚, Ισπανία
Andres Moya, Πανεπιστήμιο της Βαλένθια, Ισπανία

Πνευματικά δικαιώματα: © 2013 Baquero, Tedim and Coque. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοιχτής πρόσβασης που διανέμεται σύμφωνα με τους όρους της άδειας αναφοράς Creative Commons, η οποία επιτρέπει τη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε άλλα φόρουμ, υπό την προϋπόθεση ότι οι αρχικοί συντάκτες και η πηγή πιστώνονται και υπόκεινται σε ειδοποιήσεις πνευματικών δικαιωμάτων σχετικά με τυχόν γραφικά τρίτων κ.λπ. .


Δες το βίντεο: Αντιβιοτικά και μικροβιακή αντοχή (Νοέμβριος 2022).